本文内容如下gydF4y2Bae-collection /主题问题:gydF4y2Ba

基于网络和移动的卫生干预措施(2186)gydF4y2Ba 药物警戒(82)gydF4y2Ba 药物不良事件检测、药物警戒和监测(92)gydF4y2Ba

发表在gydF4y2Ba在gydF4y2Ba24卷gydF4y2Ba，第10位gydF4y2Ba(2022)gydF4y2Ba: 10月gydF4y2Ba

本文的预印本(早期版本)可在gydF4y2Bahttps://preprints.www.mybigtv.com/preprint/35464gydF4y2Ba，首次出版gydF4y2Ba．gydF4y2Ba
药物不良反应(RS-ADR)信号评估的数据驱动参考标准:开发和验证gydF4y2Ba

药物不良反应(RS-ADR)信号评估的数据驱动参考标准:开发和验证gydF4y2Ba

药物不良反应(RS-ADR)信号评估的数据驱动参考标准:开发和验证gydF4y2Ba

本文作者:gydF4y2Ba

Suehyun李gydF4y2Ba1gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba 李正勋gydF4y2Ba2gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba Grace Juyun KimgydF4y2Ba2gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba Jong-Yeup金gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba Hyunah胫骨gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba Inseok KogydF4y2Ba3.gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba Seon ChoegydF4y2Ba2gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba；gydF4y2Ba 金珠韩gydF4y2Ba2gydF4y2Ba 作者:OrcidgydF4y2Ba
文章gydF4y2Ba 作者gydF4y2Ba 引用的gydF4y2Ba Tweetations (6)gydF4y2Ba 指标gydF4y2Ba

    原始论文gydF4y2Ba

    1gydF4y2Ba韩国大田建阳大学医学院生物医学信息系gydF4y2Ba

    2gydF4y2Ba首尔国立大学生物医学信息学(SNUBI)，首尔国立大学医学院生物医学信息学学部，韩国首尔gydF4y2Ba

    3.gydF4y2Ba韩国大田建阳大学医院医疗保健数据科学中心gydF4y2Ba

    通讯作者:gydF4y2Ba

    Kim Ju Han，医学博士，博士gydF4y2Ba

    首尔大学生物医学信息学(SNUBI)gydF4y2Ba

    生物医学信息学处gydF4y2Ba

    首尔大学医学院gydF4y2Ba

    钟路区大学路103号gydF4y2Ba

    首尔,03080gydF4y2Ba

    大韩民国gydF4y2Ba

    电话:82 010 4636 2227gydF4y2Ba

    电子邮件:gydF4y2Bajuhan@snu.ac.krgydF4y2Ba


    背景:gydF4y2Ba使用真实世界数据(RWD)的药物警戒，如多中心电子健康记录(EHRs)，产生大量平行的药物不良反应(ADR)信号。然而，由于缺乏阳性和阴性关联的参考标准，对计算检测到的ADR信号进行适当验证是不可能的。gydF4y2Ba

    摘要目的:gydF4y2Ba本研究旨在建立一个ADR (RS-ADR)的参考标准，以简化RWD分析所提示的几乎所有药物-ADR关联的系统检测、评估和理解。gydF4y2Ba

    方法:gydF4y2Ba我们整合了众所周知的药物- adr对参考集，包括副作用资源、观察性医疗结果伙伴关系和EU-ADR。我们使用受控词汇和系统注释的电子病历数据创建了一个药物警戒词典。从多中心电子病历的MetaLAB和MetaNurse分析中计算出的药物- adr关联，并从食品和药物管理局不良事件报告系统中提取，通过机构间的交叉验证，将其整合为“经验确定”的阳性和阴性参考集。gydF4y2Ba

    结果:gydF4y2BaRS-ADR包括1344种药物，4485种不良反应，6027840对药物- adr，作为药物警戒参考集。经过RS-ADR初版的整理，发现了“法莫替丁-肝功能异常”等新的ADR信号，并通过RS-ADR进行了合理验证。虽然整个参考标准的验证具有挑战性，特别是对于这个初始版本，但随着更多的RWD参与先进的药物警戒词典和分析算法的共识投票，参考标准将得到改进。您可以通过我们基于web的rs - adr搜索界面检查是否报告了药物- adr对。gydF4y2Ba

    结论:gydF4y2Ba丰富了药物警戒词典、ADR知识和来自电子病历的真实证据的rs -ADR可以简化对计算检测到的ADR信号的系统检测、评估和因果关系评估。gydF4y2Ba

    [J] .中国医学信息学报，2010;24(10):563 - 564gydF4y2Ba

    doi: 10.2196/35464gydF4y2Ba

    关键字gydF4y2Ba

    药物不良反应gydF4y2Ba；gydF4y2Ba 美国存托凭证gydF4y2Ba；gydF4y2Ba 真实的数据gydF4y2Ba；gydF4y2Ba RWDgydF4y2Ba；gydF4y2Ba 真实的证据gydF4y2Ba；gydF4y2Ba RWEgydF4y2Ba；gydF4y2Ba 药物警戒gydF4y2Ba；gydF4y2Ba 光伏gydF4y2Ba；gydF4y2Ba 参考标准gydF4y2Ba；gydF4y2Ba 药理学gydF4y2Ba；gydF4y2Ba 药物反应gydF4y2Ba


    理论gydF4y2Ba

    越来越多的研究报告了在III期临床试验中未发现的严重上市后药物不良反应(adr)。临床试验在反映具有不同人口统计学特征和合并症的患者同时服用多种药物的现实环境方面具有固有的局限性[gydF4y2Ba1gydF4y2Ba］.现实世界的因素，如标签外药物处方和不规律的药物摄入，增加了临床试验中遗漏adr的风险。临床试验难以识别现实环境中发生的不良反应，如延迟性不良反应和长期药物暴露的影响[gydF4y2Ba2gydF4y2Ba］.据报道，在美国，与不良反应相关的发病率和死亡率的医疗费用每年超过750亿美元[gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba，gydF4y2Ba4gydF4y2Ba］.因此，上市后药品安全监测的重要性怎么强调都不为过。药物安全监测在管理和预防潜在的不良反应方面发挥作用，涉及范围广泛的活动，包括与不良反应有关的整个收集、分析和监测周期。不良反应信号以多种形式存在，如临床体征、症状、疾病或死亡。自发报告系统，收集可疑的上市后adr并进行因果关系评估[gydF4y2Ba5gydF4y2Ba，都有固有的偏见。gydF4y2Ba

    之前的工作gydF4y2Ba

    使用真实世界数据(RWD)大规模并行检测几乎所有药物-不良反应相互作用的计算方法，如索赔和多中心电子健康记录(EHRs)，正在作为相对公正的方法出现[gydF4y2Ba6gydF4y2Ba-gydF4y2Ba16gydF4y2Ba］.然而，验证大量检测到的ADR信号是具有挑战性的，因为缺乏“金标准”或所有成对药物-ADR关联的既定参考集。此外，确定消极联系甚至比确定积极联系更难。即使是由主要机构提供的大型、专家编制的参考标准，在正确评估所有计算检测到的药物-不良反应相互作用方面也令人失望地不足。参考标准包括一组确实与adr相关的阳性病例和极不可能与adr相关的阴性对照。参考标准应具有强大的功能，具有多种药物和不良反应的多样性，以确保普遍性[gydF4y2Ba17gydF4y2Ba］.gydF4y2Ba

    Coloma等[gydF4y2Ba10gydF4y2Ba]制定了一个参考标准，其中有44个积极关联和50个消极关联。观察性医疗结果伙伴关系(OMOP)从其资源中提供了165个阳性结果和234个阴性结果的综合汇编[gydF4y2Ba18gydF4y2Ba］.根据文献综述，EU-ADR列出了10种与药物使用相关的事件，包括44例阳性对照和50例阴性对照[gydF4y2Ba10gydF4y2Ba］.最近，观察健康数据科学和信息学发表了1000种药物和100种健康结果的知识库[gydF4y2Ba19gydF4y2Ba］.观察健康数据科学和信息学小组开发并测试了自动参考集的准确性，以减少人工管理[gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba］.考虑到以前的研究[gydF4y2Ba18gydF4y2Ba-gydF4y2Ba21gydF4y2Ba]主要依赖文献和自发报告，因此需要协调来自不同数据源的证据。gydF4y2Ba

    在计算机上，使用RWD进行ADR检测比依靠专家管理制定参考标准要快得多。RWD分析有可能为ADR信号评价提供参考标准。具有丰富语义的受控词汇的系统应用是利用RWD进行计算机药物警戒的必要条件。基于受控词汇表的ADR信号字典(CVAD)将受控词汇表与EHR数据相结合，以提高PV [gydF4y2Ba22gydF4y2Ba］.CVAD的发展源于先前对大规模并行ADR信号检测算法的研究，该算法使用实验室结果和标准护理声明，如MetaLAB和MetaNurse [gydF4y2Ba23gydF4y2Ba］.鉴于阳性和阴性参考集的数量有限，通过数千个ADR信号正确验证101种预防性药物的阳性和阴性药物-ADR关联具有挑战性。在RWD和real-world evidence (RWE)的新时代，需要一个全面的药物- adr对参考标准，并配备标准的词汇注释。gydF4y2Ba

    对于PV的预防和管理，最好采用多数据源集成的策略。Wei等[gydF4y2Ba24gydF4y2Ba，gydF4y2Ba25gydF4y2Ba将RxNorm、Side Effect Resource (SIDER)、MedlinePlus和Wikipedia结合起来，组成一个药物适应症资源(MEDI)。Gottesman等[gydF4y2Ba26gydF4y2Ba]开发了电子医疗记录和基因组学网络，推动了临床信息学、基因组科学和社区咨询，这是将基因组信息纳入常规医疗服务的第一步。此外，由于需要采用数据驱动的方法，一些国家正在执行国家一级的项目，或授权进行有关的研究。gydF4y2Ba

    本研究目的gydF4y2Ba

    无论数据来源如何，药物安全监测的一个关键挑战是需要公开、可靠和足够大的参考标准。虽然没有确定的参考标准包含一套完整的adr，但我们打算汇总来自多个数据源的信息以构成一套adr。在这项研究中，我们制定了一个ADR参考标准(RS-ADR)，以便对RWD计算检测到的大量ADR信号进行全面、高效和实用的评估。RS-ADR整合了EHR术语相关的标准ADR术语，包括来自《监管活动医学词典》(MedDRA)优选术语(PTs)、世卫组织不良反应术语(WHO- art)、逻辑观察标识名称和代码(LOINC)和国际疾病分类第十版(ICD-10)的术语。我们通过汇总RWD的大量平行结果以及从众多医疗机构中提取的阳性和阴性病例的交叉验证，创建了RS-ADR。其他PV资源，包括OMOP和EU-ADR参考标准、美国食品及药物管理局不良事件报告系统(FAERS) [gydF4y2Ba27gydF4y2Ba]和SIDER 4.1作为参考集，并添加了受控PV词汇，以改进药物- adr关联的系统性因果关系评估。我们试图分析和比较以前发表的参考集，显著增加病例数量，并通过专注于术语标准化来开发RS-ADR。gydF4y2Ba


    ADR信号评价参考集的开发gydF4y2Ba

    由于缺乏一个“金标准”来评估PV研究中检测到的真实和虚假的ADR信号，许多研究人员试图组成特别的“金标准”集。gydF4y2Ba表1gydF4y2Ba从数据来源、药品和不良反应数量、药品-不良反应对数量、真阳性和阴性病例、对照词汇和证据等方面总结了拟采用的“金标准”集的不同特征。这些研究创建这些参考标准的主要目的是评估所提出算法的性能。ADR信号主要由实验室检测结果和临床事件(如症状)来定义。gydF4y2Ba

    表1。药物警戒方法学研究创建和使用的参考集。gydF4y2Ba
    参考集gydF4y2Ba 数据源gydF4y2Ba 药物、ngydF4y2Ba 药物不良反应gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba 词汇表gydF4y2Ba



    		adr, ngydF4y2Ba 药物- adr对，名词gydF4y2Ba 正情况，ngydF4y2Ba 负情况，ngydF4y2Ba
    RS-ADRgydF4y2BabgydF4y2Ba 实验室测试和事件(症状)gydF4y2Ba 1344gydF4y2Ba 4485gydF4y2Ba 6027840年gydF4y2Ba 141729年gydF4y2Ba 2330gydF4y2Ba 空中交通管制gydF4y2BacgydF4y2Ba, MedDRAgydF4y2BadgydF4y2Ba,是谁gydF4y2BaegydF4y2Ba, LOINCgydF4y2BafgydF4y2Ba，以及ICDgydF4y2BaggydF4y2Ba
    Harpaz等[gydF4y2Ba13gydF4y2Ba), 2012年gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 44gydF4y2Ba 38gydF4y2Ba 137gydF4y2Ba 62gydF4y2Ba 75gydF4y2Ba RxNorm和MedDRAgydF4y2Ba
    Yoon等[gydF4y2Ba14gydF4y2Ba), 2012年gydF4y2Ba 实验室测试gydF4y2Ba 10gydF4y2Ba 51gydF4y2Ba 510gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2BahgydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 没有一个gydF4y2Ba
    Liu等[gydF4y2Ba15gydF4y2Ba), 2013年gydF4y2Ba 实验室测试gydF4y2Ba 9gydF4y2Ba 42gydF4y2Ba 378gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 没有一个gydF4y2Ba
    LePendu等[gydF4y2Ba16gydF4y2Ba), 2013年gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 78gydF4y2Ba 12gydF4y2Ba 193gydF4y2Ba 28gydF4y2Ba 165gydF4y2Ba MedDRAgydF4y2Ba
    Alvarez等[gydF4y2Ba28gydF4y2Ba), 2010年gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 267gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 532gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba MedDRAgydF4y2Ba
    Hochberg等[gydF4y2Ba29gydF4y2Ba), 2009年gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 35gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 6207gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba MedDRAgydF4y2Ba
    Ryan等[gydF4y2Ba30.gydF4y2Ba， 2012 (omop)gydF4y2Ba我gydF4y2Ba版本1)gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 10gydF4y2Ba 9gydF4y2Ba 90gydF4y2Ba 9gydF4y2Ba 44gydF4y2Ba 没有一个gydF4y2Ba
    Ryan等[gydF4y2Ba18gydF4y2Ba]， 2013 (OMOP版本2)gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 191gydF4y2Ba 4gydF4y2Ba 398gydF4y2Ba 165gydF4y2Ba 234gydF4y2Ba 没有一个gydF4y2Ba
    Coloma等[gydF4y2Ba10gydF4y2Ba]， 2013年(eu-adr)gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 66gydF4y2Ba 10gydF4y2Ba 94gydF4y2Ba 43gydF4y2Ba 50gydF4y2Ba 没有一个gydF4y2Ba
    Boyce等[gydF4y2Ba19gydF4y2Ba[qh]， 2014gydF4y2BajgydF4y2Ba知识库)gydF4y2Ba 事件(症状)gydF4y2Ba 1000gydF4y2Ba One hundred.gydF4y2Ba 100，000gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba ATC、RxNorm和ICDgydF4y2Ba

    一个gydF4y2BaADR:药物不良反应。gydF4y2Ba

    bgydF4y2BaRS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba

    cgydF4y2Ba解剖治疗化学。gydF4y2Ba

    dgydF4y2BaMedDRA:监管活动医学词典。gydF4y2Ba

    egydF4y2Ba世界卫生组织不良反应术语。gydF4y2Ba

    fgydF4y2BaLOINC:逻辑观察标识符名称和代码。gydF4y2Ba

    ggydF4y2Ba国际疾病分类。gydF4y2Ba

    hgydF4y2Ba不可用。gydF4y2Ba

    我gydF4y2BaOMOP:观察性医疗结果伙伴关系。gydF4y2Ba

    jgydF4y2BaOHDSI:观察健康数据科学和信息学。gydF4y2Ba

    构建rs - adr的实用数据库为SIDER 4.1、OMOP和EU-ADR。SIDER 4.1包含来自各种参考文献的药物数量、adr、药物- adr对和药物频次条目[gydF4y2Ba31gydF4y2Ba］.此外，还有各种数据库(如Sentinel和National Patient-Centered Clinical Research Network)，但OMOP和EU-ADR在PV的所有领域使用最多，并提供了实际的参考集。研究者手工查阅相关文献，经临床医生确认后最终选择数据库。OMOP数据库的数据来源于美国的私人承包商，而EU-ADR数据库的数据来源于欧洲的全国性登记处。两者都用于识别已知的药物关联和以前未知的信号[gydF4y2Ba32gydF4y2Ba］.gydF4y2Ba

    参考标准对于评估综合PV研究的分析结果和系统地积累证据至关重要[gydF4y2Ba13gydF4y2Ba-gydF4y2Ba31gydF4y2Ba］.因此，我们首先基于OMOP和EU-ADR项目创建了一个参考标准。RS-ADR的构建总共采用了4个步骤:(1)受控词汇标注，(2)参考集构建，(3)分布式分析结果，(4)药物- adr对meta分析(gydF4y2Ba图1gydF4y2Ba）.每个部分的作用将在以下章节中详细说明。gydF4y2Ba

    ‎gydF4y2Ba
    图1所示。RS-ADR的构建流程图，它使用电子健康记录数据(临床叙述、实验室测试和疾病分类)。ADR:药物不良反应;CDM:公共数据模型;数据库:数据库;EHR:电子健康记录;FAERS:美国食品药品监督管理局不良事件报告系统;HR:风险比;监管活动医学词典;OMOP:观察性医疗成果伙伴关系; PT: preferred term; RS-ADR: reference standard for adverse drug reaction.
    查看此图gydF4y2Ba

    第1部分:受控词汇表注释gydF4y2Ba

    包含疾病分类、实验室测试、药物和临床叙述的受控词汇的综合注释使广泛的EHR数据探索成为可能。在许多研究中，实验室结果是最常用的ADR信号检测方法。CVAD便于使用各种数据源来检测ADR信号[gydF4y2Ba22gydF4y2Ba］.临床记录，如首尔国立大学医院(SNUH)基于国际护理实践理事会的标准护理声明(SNSs)被映射到WHO-ART，首尔国立大学医院或亚洲大学医院的实验室检测结果被映射到LOINC，行政术语被映射到ICD-10，药物被映射到ATC分类。涉及叙述性、试验性或行政性术语的制图方案已在其他地方详细描述[gydF4y2Ba22gydF4y2Ba］.gydF4y2Ba

    第2部分:参考集构造gydF4y2Ba

    OMOP还提供了一个参考集，由165对阳性和234对阴性药物- adr信号对组成，覆盖了189种药物和4种adr之间的756对(189 × 4)对中的53% [gydF4y2Ba15gydF4y2Ba］.EU-ADR项目参考集涵盖68种药物和10种adr，其中阳性药物adr信号对44对，阴性药物adr信号对50对，覆盖率13.8% [gydF4y2Ba16gydF4y2Ba］.SIDER 4.1编制的参考集包括1344种药物的140,230对MedDRA PTs阳性和4485种副作用，未提供阴性对照[gydF4y2Ba31gydF4y2Ba］.药物- adr对的SIDER 4.1覆盖率为2.3%。gydF4y2Ba

    我们使用MedDRA同义词(统一医学语言系统概念ID)将OMOP的4个adr和EU-ADR的10个adr映射到SIDER 4.1中的4485个MedDRA术语。我们建立了1344种药物和4485种adr的参考标准矩阵，返回6027840对药物- adr。参考矩阵的每个单元格的值用0填充阴性对照，1填充阳性对照，2填充未知对照。阴性对照是那些已知不会引起结果的对照，使用病例报告、病例系列或OMOP和EU-ADR的观察性证据。阳性对照从美国FDA SIDER 4.1、OMOP和EU-ADR (gydF4y2Ba图1gydF4y2Ba）.gydF4y2Ba

    第3部分:分布式PV分析结果gydF4y2Ba

    我们将来自不同机构的光伏分析数据作为基准[gydF4y2Ba18gydF4y2Ba]并整合了来自各种资源的结果，如自发报告(即FAERS数据)、索赔和电子病历数据，用于开发RS-ADR。分析2012年1月至2018年12月FAERS数据[gydF4y2Ba27gydF4y2Ba］.我们对两家医院(首尔国立大学和锦阳大学医院)的整个电子病历数据集进行了meta -护士和meta - ab分析，使用先进的受试者抽样策略来管理药物、实验室结果和sns。从两个EHR数据集中检测到的ADR信号分别使用11,817和76,457个药物-ADR对根据SIDER 4.1进行验证[gydF4y2Ba23gydF4y2Ba］.我们利用自发报告和电子病历数据探讨了药物- adr对之间的关系。gydF4y2Ba表2gydF4y2Ba显示了我们对算法检测到的“氟康唑-低钾血症”关联的验证工作的共识模板。以前的研究没有使用标注的对照词汇，在评估研究结果时遇到了困难[gydF4y2Ba33gydF4y2Ba］.gydF4y2Ba

    表2。RS-ADR示例gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba输出“氟康唑”和“低钾血症”之间的关联。gydF4y2Ba
    输出,名字gydF4y2Ba 例子gydF4y2Ba
    药物gydF4y2Ba


    		药物gydF4y2Ba 氟康唑gydF4y2Ba


    		空中交通管制gydF4y2BabgydF4y2Ba代码gydF4y2Ba J02AC01gydF4y2Ba
    美国存托凭证gydF4y2BacgydF4y2Ba


    		MedDRAgydF4y2BadgydF4y2BaPTgydF4y2BaegydF4y2Ba 低钾血gydF4y2Ba


    		系统器官类别gydF4y2Ba 代谢和营养紊乱gydF4y2Ba
    第1部分gydF4y2Ba

    		临床的叙述gydF4y2Ba


    		是谁gydF4y2BafgydF4y2Ba 低钾血gydF4y2Ba


    		SNSgydF4y2BaggydF4y2BaSNUH的条款gydF4y2BahgydF4y2Ba 血清钾水平正常|低钾血症gydF4y2Ba


    		ICNPgydF4y2Ba我gydF4y2Ba "毫克/分升" "不平衡"和"液体量"gydF4y2Ba

    		实验室结果gydF4y2Ba


    		LOINCgydF4y2BajgydF4y2BaIDgydF4y2Ba 2823年_3gydF4y2Ba


    		通用名称gydF4y2Ba 血清或血浆中的钾(摩尔/体积)gydF4y2Ba


    		SNUH实验室测试代码gydF4y2Ba L3044gydF4y2Ba


    		SNUH实验室测试名称gydF4y2Ba 钾(血清)gydF4y2Ba


    		AJUHgydF4y2BakgydF4y2Ba实验室试验规程gydF4y2Ba 35gydF4y2Ba


    		AJUH实验室检测名称gydF4y2Ba 钾gydF4y2Ba

    		疾病分类gydF4y2Ba


    		ICDgydF4y2BalgydF4y2Ba代码gydF4y2Ba E87.6gydF4y2Ba


    		ICD的名字gydF4y2Ba 低钾血gydF4y2Ba
    第2部分gydF4y2Ba

    		证据来源(0=阴性对照，1=阳性对照，2=未知)gydF4y2Ba


    		食品及药物管理局gydF4y2Ba米gydF4y2Ba产品标签gydF4y2Ba：gydF4y2Ba帮派成员gydF4y2BangydF4y2Ba 1gydF4y2Ba


    		FDA产品标签及文献:OMOPgydF4y2BaogydF4y2Ba 2gydF4y2Ba


    		FDA产品标签、文献、自发数据和作用机制:EU-ADRgydF4y2Ba 2gydF4y2Ba
    第3部分gydF4y2Ba

    		数据合作伙伴:SNUH (EHR)gydF4y2BapgydF4y2Ba基于MetaNurse)gydF4y2Ba


    		风险比gydF4y2Ba 1.47gydF4y2Ba


    		PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba

    		数据合作伙伴:SNUH(基于ehr的MetaLAB)gydF4y2Ba


    		优势比gydF4y2Ba 3.04gydF4y2Ba


    		PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba

    		数据合作伙伴:KYUHgydF4y2Ba问gydF4y2Ba(EHR-based MetaLAB)gydF4y2Ba


    		优势比gydF4y2Ba 1.58gydF4y2Ba


    		PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba

    		数据合作伙伴:FAERSgydF4y2BargydF4y2Ba


    		报告优势比gydF4y2Ba 1.83gydF4y2Ba


    		PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba

    		数据合作伙伴(N)gydF4y2Ba


    		优势比gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba年代gydF4y2Ba


    		PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba
    第4部分gydF4y2Ba

    		荟萃分析gydF4y2Ba


    		优势比(95% CI)gydF4y2Ba 1.69 (1.60 - -1.79)gydF4y2Ba


    		因果关系评估gydF4y2Ba 可能的gydF4y2Ba

    一个gydF4y2BaRS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba

    bgydF4y2Ba解剖治疗化学。gydF4y2Ba

    cgydF4y2BaADR:药物不良反应。gydF4y2Ba

    dgydF4y2BaMedDRA:监管活动医学词典。gydF4y2Ba

    egydF4y2BaPT:首选术语。gydF4y2Ba

    fgydF4y2Ba世界卫生组织不良反应术语。gydF4y2Ba

    ggydF4y2BaSNS:标准护理声明。gydF4y2Ba

    hgydF4y2Ba首尔大学医院。gydF4y2Ba

    我gydF4y2Ba国际护理实践理事会。gydF4y2Ba

    jgydF4y2BaLOINC:逻辑观察标识符名称和代码。gydF4y2Ba

    kgydF4y2Ba亚州大学医院。gydF4y2Ba

    lgydF4y2Ba国际疾病分类。gydF4y2Ba

    米gydF4y2BaFDA:食品和药物管理局。gydF4y2Ba

    ngydF4y2Ba方:副作用资源。gydF4y2Ba

    ogydF4y2BaOMOP:观察性医疗结果伙伴关系。gydF4y2Ba

    pgydF4y2Ba电子健康记录。gydF4y2Ba

    问gydF4y2BaKYUH:建阳大学医院。gydF4y2Ba

    rgydF4y2BaFAERS:美国食品和药物管理局不良事件报告系统。gydF4y2Ba

    年代gydF4y2Ba不可用。gydF4y2Ba

    第四部分:药物- adr对的meta分析gydF4y2Ba

    我们从多个电子病历中评估了MetaLAB和MetaNurse分析的药物-不良反应对，并将其与FAERS进行因果关系评估的比较如下:确定的、可能的/可能的、可能的、不太可能的或有条件的/未分类的[gydF4y2Ba10gydF4y2Ba］.我们应用随机效应模型对许多结果进行荟萃分析，以管理自发报告和电子病历的异构数据特征。为了评估因果关系，我们通过让专家参考SIDER 4.1和其他现有参考文献进行了专家评审。随后，收集各卫生保健机构产生的pv分布分析结果，对每个药物- adr对进行因果关系评估。随着越来越多的数据伙伴提供研究结果，每个药物- adr对的因果关系评估可以得到改进。gydF4y2Ba

    道德的考虑gydF4y2Ba

    本研究已获得锦阳大学医院机构审查委员会批准(IRB号2019-08-018)。gydF4y2Ba


    RS-ADR统计gydF4y2Ba

    RS-ADR包含1344种药物，按MedDRA PTs计算，adr为4485个(gydF4y2Ba表3gydF4y2Ba和gydF4y2Ba4gydF4y2Ba）.映射到MedDRA PTs的对照词汇数为1130个临床叙述、942个实验室结果和83个疾病分类。对于阳性对照，我们从SIDER 4.1中找到140230对药物- adr，从OMOP中找到1556对，从EU-ADR数据库中找到421对。阴性对照分别为来自OMOP和EU-ADR的2801对和349对。根据MedDRA系统器官分类(soc)的临床叙述、实验室结果和疾病分类对adr进行检查，分别覆盖26个MedDRA器官分类中的25个、23个和16个(gydF4y2Ba多媒体附录1gydF4y2Ba）.虽然以前的ADR研究主要分析实验室结果，但我们浏览了1762例与RS-ADR相关的综合ADR(即临床叙述、实验室检查和疾病分类的交集)。gydF4y2Ba

    表3。RS-ADRgydF4y2Ba一个gydF4y2Ba统计数据。gydF4y2Ba
    统计gydF4y2Ba n值,gydF4y2Ba
    药物gydF4y2Ba 1344gydF4y2Ba
    药物不良反应gydF4y2BabgydF4y2Ba(MedDRAgydF4y2BacgydF4y2Ba首选项)gydF4y2Ba

    		总计gydF4y2Ba 4485gydF4y2Ba

    		临床的叙述gydF4y2Ba 1130gydF4y2Ba

    		实验室测试gydF4y2Ba 942gydF4y2Ba

    		疾病分类gydF4y2Ba 83gydF4y2Ba

    		没有映射gydF4y2Ba 2723gydF4y2Ba
    药物-不良反应对(药物数×不良反应数)gydF4y2Ba 6027840年gydF4y2Ba

    一个gydF4y2BaRS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba

    bgydF4y2BaADR:药物不良反应。gydF4y2Ba

    cgydF4y2BaMedDRA:监管活动医学词典。gydF4y2Ba
    表4。RS-ADRgydF4y2Ba一个gydF4y2Ba与其他参考集比较的统计数据。gydF4y2Ba
    统计gydF4y2Ba 帮派成员gydF4y2BabgydF4y2Ba OMOPgydF4y2BacgydF4y2Ba EU-ADRgydF4y2Ba
    阳性对照，ngydF4y2Ba 140230年gydF4y2Ba 1556gydF4y2Ba 421gydF4y2Ba
    阴性对照，ngydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2BadgydF4y2Ba 2801gydF4y2Ba 349gydF4y2Ba
    未知drug-ADRgydF4y2BaegydF4y2Ba对,ngydF4y2Ba 5887610年gydF4y2Ba 6023483年gydF4y2Ba 6027070年gydF4y2Ba

    一个gydF4y2BaRS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba

    bgydF4y2Ba方:副作用资源。gydF4y2Ba

    cgydF4y2BaOMOP:观察性医疗结果伙伴关系。gydF4y2Ba

    dgydF4y2Ba不可用。gydF4y2Ba

    egydF4y2BaADR:药物不良反应。gydF4y2Ba

    RS-ADR应用实例gydF4y2Ba

    从第1部分到第4部分RS-ADR构建的过程简单总结如下:首先，针对药物和adr;第1部分，术语码确认;在第2部分中，识别现有参考集中描述的内容;第三部分，按数据源分析;第四部分，通过元分析进行因果关系评价。gydF4y2Ba表2gydF4y2Ba显示了RS-ADR关于“氟康唑”和“低钾血症”之间关系的查询结果，这解释了从第1部分到第4部分的顺序进展。第一部分由3个部分组成:临床叙述、实验室结果和管理数据。临床叙述以WHO-ART“低钾血症”注释;SNS“血钾水平低于正常值”;国际护理实践理事会“毫克/分升”、“不平衡”和“液体体积”标准术语。实验室结果被映射到多达6项测试，包括LOINC“血清或血浆中钾(摩尔/体积)”。RS-ADR也指示了检测结果高于或低于正常范围的方向。与ADR低钾血症相关的行政术语为ICD-10 E87.6代码。第2部分介绍了药物不良反应与阳性对照、阴性对照和未知证据相关的证据来源。证据来源可以是FDA产品标签、文献、自发报告和作用机制。 Part 3 designated the partner health care organizations where the ADR analysis data were collected. MetaLAB and MetaNurse analyses were included [23gydF4y2Ba］.最后，第4部分描述了如何评估药物-不良反应发生之间的因果关系。“氟康唑”与“低钾血症”之间关联的荟萃分析显示优势比为1.69 (95% CI, 1.60-1.79)。总的来说，2个电子病历和2个自发报告数据集显示了RS-ADR的可扩展性和可用性(gydF4y2Ba图2gydF4y2Ba）.通过RWD分析增加药物- adr对，可以提高RS-ADR的可用性。根据世卫组织-乌普萨拉监测中心的因果关系分类，对"氟康唑"和"低钾血症"之间的关联进行了"可能"的评估，因为这一类包括"事件或实验室检测异常" (gydF4y2Ba表2gydF4y2Ba) [gydF4y2Ba33gydF4y2Ba］.gydF4y2Ba

    ‎gydF4y2Ba
    图2。RS-ADR的例子(第3部分)，通过使用来自两家医院(首尔国立大学医院[SNUH]和康阳大学医院[KYUH])的电子健康记录(EHRs)和食品和药物管理局不良事件报告系统(FAERS)的数据来评估药物“氟康唑”和“低钾血症”之间的关联。RS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba
    查看此图gydF4y2Ba

    利用RWE改进参考标准gydF4y2Ba

    表5gydF4y2Ba显示了先前在SIDER 4.1、OMOP和EU-ADR中未知的4对药物- adr。在这方面，我们发现2个药物-ADR对被添加到韩国FDA ADR标签中[gydF4y2Ba34gydF4y2Ba]，这表明它们可能被确定为假阳性。例如，法莫替丁用于胃酸分泌相关的胃肠道疾病(如胃溃疡)和胃食管反流病[gydF4y2Ba35gydF4y2Ba］.RS-ADR发现的新型“法莫替丁-肝功能异常”对已被2个机构的电子病历和美国FAERS成功验证[gydF4y2Ba35gydF4y2Ba］.此外，根据Micromedex [gydF4y2Ba36gydF4y2Ba数据库和Gupta等人的研究[gydF4y2Ba37gydF4y2Ba]，我们发现法莫替丁-肝功能异常对已被记录为可能的不良反应。RWD/RWE的观点表明，新发现可能确实表明了多机构交叉验证支持的真正积极的结果。我们对氯氮平和双氯芬酸进行了同样的分析，发现了潜在的药物不良反应对“氯氮平-肝功能异常”、“双氯芬酸-血管性水肿”和“双氯芬酸-面部水肿”的合理支持(有保留)。gydF4y2Ba表5gydF4y2Ba）.gydF4y2Ba

    表5所示。RS-ADRgydF4y2Ba一个gydF4y2Ba证明药物不良反应有多严重gydF4y2BabgydF4y2Ba对正在使用电子病历gydF4y2BacgydF4y2Ba2家医院(首尔大学医院[SNUH]和锦阳大学医院[KYUH])的数据和食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)的数据。gydF4y2Ba
    药物gydF4y2Ba 美国存托凭证gydF4y2Ba RS-ADRgydF4y2Ba 参考gydF4y2Ba


    		SNUHgydF4y2Ba KYUHgydF4y2Ba FAERSgydF4y2Ba


    		EHR-based MetaNursegydF4y2Ba EHR-based MetaLABgydF4y2Ba EHR-based MetaLABgydF4y2Ba



    		人力资源gydF4y2BadgydF4y2Ba PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba 或gydF4y2BaegydF4y2Ba PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba 或gydF4y2Ba PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba 或gydF4y2Ba PgydF4y2Ba价值gydF4y2Ba
    法莫替丁gydF4y2Ba 肝功能异常gydF4y2Ba 1.79gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba 2.19gydF4y2Ba .003gydF4y2Ba 1.11gydF4y2Ba .008gydF4y2Ba 3.97gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba Gupta等[gydF4y2Ba37gydF4y2Ba), 2009年gydF4y2Ba
    氯氮平gydF4y2Ba 肝功能异常gydF4y2Ba 0.55gydF4y2Ba .04点gydF4y2Ba 1.38gydF4y2Ba . 01gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2BafgydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 1.02gydF4y2Ba .85gydF4y2Ba 吴丑等[gydF4y2Ba38gydF4y2Ba), 2014年gydF4y2Ba
    双氯芬酸gydF4y2Ba 血管性水肿gydF4y2Ba 0.96gydF4y2Ba 票价gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 5.13gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba 派斯和帕德沃[gydF4y2Ba39gydF4y2Ba), 2015年gydF4y2Ba
    双氯芬酸gydF4y2Ba 脸水肿gydF4y2Ba 2.38gydF4y2Ba .20gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba - - - - - -gydF4y2Ba 1.95gydF4y2Ba ＜.001gydF4y2Ba Jha等[gydF4y2Ba40gydF4y2Ba), 2015年gydF4y2Ba

    一个gydF4y2BaRS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba

    bgydF4y2BaADR:药物不良反应。gydF4y2Ba

    cgydF4y2Ba电子健康记录。gydF4y2Ba

    dgydF4y2BaHR:风险比。gydF4y2Ba

    egydF4y2BaOD:比值比。gydF4y2Ba

    fgydF4y2Ba不可用。gydF4y2Ba

    基于web的RS-ADR浏览器gydF4y2Ba

    为了为上市后药物安全性研究提供语义丰富的ADR词典，并使多中心基于电子病历的广泛ADR信号评估成为可能，我们开发了一个基于web的RS-ADR搜索界面，以探索药物-ADR之间的关联[gydF4y2Ba41gydF4y2Ba] （gydF4y2Ba图3gydF4y2Ba）.gydF4y2Ba图3gydF4y2Ba显示药物不良反应搜索功能和“法莫替丁-肝功能异常”查询结果。用户可以搜索感兴趣的药物- adr组合;每个搜索功能使用下拉菜单添加相似的单词。一个按钮清除药物不良反应组合和结果，以方便搜索。搜索结果依次为:SOC、ADR、药物、附加信息(药物的成分识别和ADR的统一医学语言系统概念ID)、参考标准(SIDER、OMOP和EU-ADR)的比较，以及EHR和FAERS的每个结果(优势比和优势比)gydF4y2BaPgydF4y2Ba值)。RS-ADR的第3部分和第4部分具有允许研究人员添加和更新其结果以改进RS-ADR的结构。gydF4y2Ba

    ‎gydF4y2Ba
    图3。RS-ADR用户界面，用于探索药物- adr关系。(A)药品不良反应搜索;(B) RS-ADR查询示例:“法莫替丁”与“肝功能异常”之间的关联。ADR:药物不良反应;CID:部件标识;OMOP:观察性医疗成果伙伴关系;RS-ADR:药品不良反应参考标准;旁方:副作用资源;SOC:系统器官类; UMLS: Unified Medical Language System.
    查看此图gydF4y2Ba

    主要研究结果gydF4y2Ba

    在这项研究中，我们展示了创建基于rwd的RS-ADR的可能性。我们集成了各种标准词汇表，以方便使用不同的机构EHR数据库以及其他PV资源，如SIDER 4.1、OMOP和EU-ADR。综合分析异质现实世界的临床信息需要一个标准的词汇来正确解释研究结果。gydF4y2Ba

    OMOP和EU-ADR的参考集[gydF4y2Ba15gydF4y2Ba，gydF4y2Ba16gydF4y2Ba]很难直接应用于PV研究，因为它们只提供了所选药物与adr之间关系的信息。为了使用这些参考集，研究人员需要对每个观测数据库进行重构，并使用受控词汇表进行注释。RS-ADR方法促进了从各种来源提取的rwd驱动证据的积累，包括许多电子病历和索赔数据库。RS-ADR使用FDA结构化产品标签和较低的ADR概念水平(如MedDRA PTs)，可检测ADR的范围被广泛扩展。低ADR概念级别最常用于标准术语系统中，以解释详细的症状，如MedDRA PTs。RS-ADR通过建立使用1344种药物和4485种adr的参考标准来补充这一局限性。本研究中使用的RS-ADR方法不像其他PV资源那样偏向于阳性结果，但由于其无偏倚的计算方法，它在阳性和阴性药物- adr关联之间取得了平衡。gydF4y2Ba多媒体附录1gydF4y2Ba显示了使用临床叙述、实验室结果和按soc分组的管理术语检测到的MedDRA pt注释的不良反应的分布。soc“感染和感染”、“精神疾病”和“眼疾”表现出许多不良反应，仅从实验室结果难以发现，需要RS-ADR中的临床叙述、护理说明和管理术语。“肌肉骨骼和结缔组织疾病”和“耳朵和迷宫疾病”的SOCs的不良反应只能通过临床叙述来发现。gydF4y2Ba

    限制gydF4y2Ba

    我们的研究有一些局限性。SIDER 4.1提供的上市后adr信息不充分，因为它包括公开文件和说明书。OMOP的4个adr和EU-ADR项目的10个adr可能强调了更频繁或长期使用的药物的adr，这在临床上也很重要。RS-ADR中使用综合ADR参考资料，如SIDER 4.1、OMOP和EU-ADR，补充了每种资源的局限性。虽然RS-ADR通过了评估人员间的协议，但专家评估实质上是有限的，并且需要持续的审查和更新。当RS-ADR与多中心和跨国数据相结合时，RS-ADR成为一种有意义的基于rwe的评价ADR信号的参考标准。使用参考标准进行方法评估的基础是假设阴性对照可与阳性对照互换[gydF4y2Ba10gydF4y2Ba，gydF4y2Ba18gydF4y2Ba］.将各种研究的药物- adr对加入RS-ADR中，可以增加其证据基础，是未来研究的一个课题。此外，考虑到RS-ADR的持续更新，计划对新药的分析和是否停止使用现有药物进行管理。对于国家使用，由于韩国食品药品安全部正在进行相关研究(例如，使用基于通用数据模型的EHR进行多中心分析，分析每个药物- adr对)，我们的团队将考虑RS-ADR的各种用途，以收集和评估研究。相反，最近研究草药相关不良反应的尝试稳步增加[gydF4y2Ba42gydF4y2Ba-gydF4y2Ba44gydF4y2Ba]，我们认为将来有可能将RS-ADR构建应用于草药领域。gydF4y2Ba

    结论gydF4y2Ba

    RS-ADR丰富了PV字典、知识和RWE，可以简化计算检测到的ADR信号的系统检测、评估和因果关系评估。通过RS-ADR，可以在临床评估阶段之前尽可能多地准备与adr相关的证据，并且可以根据医疗中心的实际数据rwd识别更多的病例。此外，由于我们考虑了药物和adr术语的标准化，因此在将来添加医疗中心或其他资源时非常有用。它不仅适用于不良反应研究，也适用于各种健康结果和卫生保健数据库利用研究。gydF4y2Ba

    致谢gydF4y2Ba

    作者要感谢韩国国家研究基金会(NRF)和食品药品安全部。本研究由教育部资助(NRF-2021R1I1A3044287)。gydF4y2Ba

    利益冲突gydF4y2Ba

    没有宣布。gydF4y2Ba

    ‎gydF4y2Ba
    多媒体附录1gydF4y2Ba

    MedDRA中每个系统器官类别的首选RS-ADR术语的药物不良反应数。ADR:药物不良反应;监管活动医学词典;RS-ADR:药品不良反应参考标准。gydF4y2Ba

    PNG文件，55kbgydF4y2Ba
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    G·艾森巴赫编辑;提交06.12.21;HW Han, C Jimeno, B Foroutan同行评审;对作者09.02.22的评论;收到订正版29.04.22;接受14.07.22;发表06.10.22gydF4y2Ba

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    ©Suehyun Lee, Jeong Hoon Lee, Grace Juyun Kim, Jong-Yeup Kim, Hyunah Shin, Inseok Ko, Seon Choe, Ju Han Kim原载于医学互联网研究杂志(//www.mybigtv.com)， 2022年10月6日。gydF4y2Ba

    这是一篇在知识共享署名许可(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)下发布的开放获取文章，该许可允许在任何媒介上不受限制地使用、分发和复制，前提是原始作品首次发表在《医学互联网研究杂志》上，并适当引用。必须包括完整的书目信息，到//www.mybigtv.com/上原始出版物的链接，以及版权和许可信息。gydF4y2Ba
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