在埃及流感样疾病监测点发现的一名患者同时感染SARS-CoV-2和甲型H1N1流感:病例报告

介绍

2019冠状病毒病疫情

COVID-19是由SARS-CoV-2病毒引起的。截至2020年9月7日，全球共报告新冠肺炎确诊病例27314629例，相关死亡893474例。1]。截至2020年9月7日，埃及共报告了99863例新冠肺炎确诊病例和5530例相关死亡病例。2]。

埃及流感样疾病监测

埃及的流感样疾病哨点监测始于2000年，地点分布在全国各地的8个哨点。在过去10天内到参与医院门诊就诊的发热和咳嗽患者需要提供咽拭子，保存在病毒运输介质中，储存在零下80摄氏度的氮罐中，并每周运送到开罗的中央公共卫生实验室，通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测流感类型和亚型。患者的人口统计和临床数据被收集在一个特殊的数据库中，并定期进行分析。每周向决策者和相关利益攸关方提供流感阳性率和流行流感类型和亚型的报告。

COVID-19大流行期间ILI监测方案的修改

自2019冠状病毒病大流行开始以来，埃及卫生和人口部(MoHP)要求所有政府医院的所有急性呼吸道症状患者由急诊科进行评估。因此，要求ILI监测小组每天在急诊科登记出现ILI症状的前2名患者，并按照通常的监测方法收集数据和样本。卫生部要求将SARS-CoV-2添加到所有ILI监测点的检测小组中。

在大流行早期，CPHL是卫生部批准进行SARS-CoV-2检测的唯一实验室。由于资源限制，从2019年10月开始暂停流感检测，并将从ILI患者收集的标本保存在-70°C，以便在可能的情况下进行后续检测。随着2020年8月埃及COVID-19患者人数开始下降，CPHL开始对在ILI站点收集的存档标本进行检测。

研究目标

2020年8月16日，中心向卫生部监测部门通报1例SARS-CoV-2和甲型H1N1流感病毒混合感染病例。本报告旨在描述该病例是如何确定的，并描述患者的人口统计学和临床特征和结果。

方法

ILI监测方法:病例发现

2000年，在埃及6个省的8个门诊诊所实施了流感病毒学监测。对参加病毒学监测的参与者(每天2-3例ILI受试者，每周6天)进行访谈，以获取其人口统计信息。采用世界卫生组织ILI监测标准招募患者，包括最近10天内发病的突发性发热≥38ºC并伴有呼吸道咳嗽表现[3.]。

在检测常规ILI样本时，中心工作人员注意到一起经PCR检测证实的SARS-CoV-2和甲型H1N1流感合并感染病例。

案件调查

CPHL的工作人员联系了一名监控人员，后者通过电话调查了这起案件。对病例患者及其接触者的临床情况、病程、严重程度危险因素、其他临床调查和疾病结局进行调查。监测数据被输入到卫生部基于网络的实时数据库中，实验室数据被输入到CPHL，与监测数据自动合并。提取2019年10月至2020年8月的ILI数据，对流感和SARS-CoV-2及其合并感染进行分析。

化验及临床调查

收集患者鼻咽拭子，使用chemic 360仪器(PerkinElmer Inc .)提取临床样本的核酸。采用VIASURE SARS-CoV-2 Real-Time PCR检测试剂盒(Certest Biotec SL)检测SARS-CoV-2 RNA (ORF1ab)。根据制造商的建议进行了三次RT-PCR检测，使用cobas 6800系统(罗氏控股公司)确认样品为SARS-CoV-2阳性。此外，利用美国疾病控制中心的方案，用实时聚合酶链反应检测了甲型H1N1流感[4]。获得了患者的全血细胞计数(CBC)和胸部计算机断层扫描(CT)图像。

结果

ILI监测病毒学结果

在2020年2月至8月采集的510份ILI症状患者标本中，29例(5.7%)呈流感阳性。其中，A(H1N1)阳性15例(51.7%)，A(H3N2)阳性11例(38.0%)，b型流感阳性3例(10.3%)。埃及于2月14日宣布了首例COVID-19病例，而ILI监测在2周后发现了首例COVID-19病例，宣布该疾病在埃及开始社区传播。在510份检测标本中，61份(12.0%)呈新冠病毒阳性(图1)。1例确诊同时感染SARS-CoV-2和甲型H1N1流感。

‎ 查看此图

个案调查结果

该病例患者于2020年5月出现在为开罗半城市地区Helwan提供服务的一个ILI监测点的门诊。患者为21岁女学生，主诉发热、咳嗽、疲劳和不适2天，无其他症状或相关合并症。患者高热40.2°C，听诊胸廓无搏动。患者CBC正常，胸部CT影像清晰，提示无下呼吸道感染。患者被拭子擦拭后送回家治疗;给予对症治疗，退烧药、止咳药和每日口服头孢地诺酯2g。她的症状持续了2天，随后完全恢复。在家中，未对该病例患者进行隔离，其5名家庭接触者中有4人在接触确诊病例2-3天后出现轻度呼吸道症状。继发病例包括2名父母(均为49岁)和2名兄弟(9岁和16岁);除患者父亲患高血压，2周内痊愈外，其余均在2-3天内痊愈。 None of the case patient’s contacts sought health care, and they all recovered without treatment.

实验室和临床调查结果

该患者经RT-PCR检测SARS-CoV-2和甲型H1N1流感均呈阳性。sars - cov - 2n基因的主周期阈值(Ct)为16.1,ORF1ab的主周期阈值为14.2 (Certest Biotec SL);SARS-CoV-2 ORF1ab基因的主Ct值为14.9,E基因的主Ct值为15.6 (cobas 6800, Roche Holding AG)。同时，甲型流感主Ct值为32.6,swFluA主Ct值为32.2,swH1主Ct值为31.6。本例患者全血细胞计数正常，胸部CT影像清晰。

讨论

SARS-CoV-2与甲型H1N1流感合并感染

本研究阐明了埃及首例SARS-CoV-2和甲型H1N1流感合并感染并伴有轻度ILI症状的病例的特征，并强调了共同检测呼吸道病毒的监测系统的益处。

其他冠状病毒与甲型流感病毒合并感染的报告[5]。在当前的COVID-19大流行期间，在包括中国、意大利、伊朗和日本在内的许多国家进行的病例研究中报告了SARS-CoV-2和甲型H1N1流感的合并感染[6-9]。

主要病毒原因

高热发作，继发潜伏期短，病情轻，病程短，提示流感是主要病原[10]。有趣的是，该患者标本的Ct值显示，SARS-CoV-2感染的病毒载量远高于甲型H1N1流感。研究表明，SARS-CoV-2的病毒载量在症状出现前后或几天后达到峰值[11]。这表明流感感染发生较早，竞争性地抑制了SARS-CoV-2的复制[12]。

埃及病例与其他国家报告的病例相比如何

人口统计资料

埃及报告的病例患者为一名年轻妇女，而其他国家报告的大多数患者年龄较大。在D 'Abramo等人的一篇小型综述中[7]对37例SARS-CoV-2合并流感感染患者进行分析，发现66.7%的患者年龄≥50岁，56.5%为男性。

病程及严重程度

其他国家报告的合并感染病例多数病程较长，且均住院治疗[6-10]。尽管埃及报告的病例患者症状轻微，但她是在常规ILI监测活动中发现的。患者病程较短，仅4天，经家庭治疗，CBC及CT胸部成像正常。她的接触者的症状甚至更轻微;因此，他们没有寻求任何医疗建议。

诱发因素

大多数合并感染的病例均存在降低免疫力的易感因素，其中许多患者需要机械通气或重症监护病房(ICU)住院[6-9，13]。合并感染患者有合并症超过60%，33%需要人工通气，29%入住ICU。迄今为止，埃及报告的病例是出现轻度上呼吸道症状的唯一国家病例。这可能与患者的年龄和性别有关，除了没有易患的合并症。

ILI患者检测结果显示，超过80%的病例SARS-CoV-2和流感均阴性。可能需要更广泛的病毒检测来确定病因，特别是如果它会影响患者的治疗[13]。

结论

埃及报告了一例伴有轻度ILI症状的SARS-CoV-2和甲型H1N1流感合并感染病例。这一发现表明，合并感染可能发生在没有合并症的年轻人群中。报告显示，患者的免疫力可以克服这两种感染，在不需要医疗程序的情况下在短时间内完全康复。ILI监测在发现ILI症状患者的病毒病因方面证明是有效的。建议扩大检测小组，特别是如果它可以指导改进病例管理指南。