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埃及对流感样疾病(ILI)的哨点监测始于2000年，分布在全国各地的8个哨点。为应对COVID-19大流行，对在一个哨点发现的前2例ILI患者进行了聚合酶链反应病毒检测，将SARS-CoV-2加入了病毒检测小组。我们报告了在埃及通过常规ILI监测发现的第一例SARS-CoV-2和A(H1N1)流感病毒合并感染，症状轻微。
本报告旨在描述该病例是如何确定的，以及患者的人口统计学和临床特征和结果。
该病例是由中央公共卫生实验室的工作人员确定的，他们联系了卫生部的ILI哨点监测官员。通过电话联系了该病例患者。获得了患者的临床图像、病程和结局的详细信息。对患者的接触者进行了急性呼吸道症状、疾病确认和预后调查。
2019年10月至2020年8月收集的510份ILI症状患者标本中，covid -19阳性61份(12.0%)，流感阳性29份(5.7%)，其中甲型H1N1流感15份(51.7%)，甲型H3N2流感11份(38.0%)，乙型流感3份(10.3%)。一名21岁的妇女被证实患有SARS-CoV-2和甲型H1N1流感病毒合并感染。患者高热40.2℃，有轻微呼吸道症状，经对症治疗2天内消退。其所有5名家庭接触者在接触确诊病例2-3天后均出现轻微呼吸道症状，无需治疗或调查，症状消失。
该病例突出表明，在年轻和健康人群中可能发生SARS-CoV-2/甲型流感(H1N1)合并感染，这些人可能会迅速消除感染。我们强调监测系统对检测ILI病毒病原体的有用性，并建议扩大检测小组，特别是如果它可以指导病例管理。
COVID-19是由SARS-CoV-2病毒引起的。截至2020年9月7日，全球共报告了27,314,629例COVID-19确诊病例和893,474例相关死亡[
埃及的流感样疾病哨点监测始于2000年，分布在全国各地的8个哨点。在过去10天内出现发烧和咳嗽症状的患者被要求提供咽拭子，以保存在病毒运输介质中，储存在-80⁰C的氮罐中，并每周运送到开罗的中央公共卫生实验室(CPHL)，通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测流感类型和亚型。患者的人口统计学和临床数据收集在一个专门的数据库中，并定期进行分析。每周向决策者和相关利益攸关方提供流感阳性率以及流行流感类型和亚型的报告。
自COVID-19大流行开始以来，埃及卫生与人口部(MoHP)要求所有政府医院的所有急性呼吸道症状患者由急诊科(ED)进行评估。因此，ILI监测小组被要求每天在急诊科登记前2例有ILI症状的患者，并遵循通常的监测方法进行数据和样本收集。卫生部要求将SARS-CoV-2纳入所有ILI监测点的检测小组。
在大流行早期，CPHL是卫生部批准进行SARS-CoV-2检测的唯一实验室。由于资源限制，从2019年10月开始暂停了流感检测，从ILI患者收集的标本在-70°C下存档，以便在可能的情况下进行后续检测。随着2020年8月埃及COVID-19患者数量开始下降，CPHL开始检测在ILI地点收集的存档标本。
2020年8月16日，卫生健康委向卫生部监测部门通报一例新型冠状病毒与甲型H1N1流感病毒混合感染病例。本报告旨在描述如何确定病例，并描述患者的人口统计学和临床特征和结果。
2000年，埃及在全国6个省的8个门诊部实施了流感病毒学监测。对参加病毒学监测的参与者(每天2-3名ILI受试者，每周6天)进行访谈，以获取他们的人口统计信息。采用世界卫生组织ILI监测标准招募患者，包括突发性发热≥38ºC，最近10天内出现咳嗽呼吸表现[
在对常规ILI样本进行检测时，CPHL工作人员注意到一例SARS-CoV-2和甲型H1N1流感合并感染病例，经PCR检测证实。
CPHL的工作人员联系了一名监控官员，后者通过电话调查了此案。调查了病例患者及其接触者的临床情况、病程、严重程度危险因素、其他临床调查和疾病转归。监测数据被输入卫生部的实时网络数据库，实验室数据被输入CPHL，并自动与监测数据合并。提取2019年10月至2020年8月的ILI数据，分析流感和SARS-CoV-2及其合并感染。
从患者身上采集鼻咽拭子，使用chemagic 360仪器(PerkinElmer Inc .)对临床样本进行核酸提取。采用VIASURE SARS-CoV-2 Real-Time PCR检测试剂盒(Certest Biotec SL)检测SARS-CoV-2 RNA (ORF1ab)。按照制造商的建议进行了三次RT-PCR，使用cobas 6800系统(罗氏控股公司)确认样本对SARS-CoV-2呈阳性。此外，利用美国疾病控制中心的协议，用实时荧光定量PCR检测甲型H1N1流感[
2020年2月至8月收集的510份ILI症状患者标本中，流感阳性29份(5.7%)。其中15例(51.7%)A(H1N1)阳性，11例(38.0%)A(H3N2)阳性，3例(10.3%)b型流感阳性。埃及于2月14日宣布了首例COVID-19病例，而ILI监测在2周后发现了首例COVID-19病例，宣布该疾病在埃及开始出现社区传播。在510份检测标本中，61份(12.0%)呈covid -19阳性(
从2019年10月至2020年9月埃及流感样疾病哨点监测中收集的510份标本的病毒原因。FLUA/H1:甲型流感(H1N1);FLUA/H3:甲型流感(H3N2);乙型流感:乙型流感。
病例患者于2020年5月被送到为开罗半城区Helwan提供服务的ILI监测点之一的门诊。患者21岁，女学生，主诉发热、咳嗽、乏力、乏力2天，无其他症状或相关共病。患者高热40.2°C，听诊胸部通畅。患者全血细胞计数正常，胸部CT显像清晰，无下呼吸道感染。病人被擦洗后送回家治疗;给予退热药、止咳药、口服头孢氨苄2克/日对症治疗。患者症状持续2天，随后完全恢复。在家中，未对该病例患者进行隔离，其5名家庭接触者中有4人在接触确诊病例2-3天后出现轻微呼吸道症状。继发病例包括2名父母(均为49岁)和2名兄弟(9岁和16岁);除病例父亲因高血压2周后康复外，其余患者均在2-3天内康复。 None of the case patient’s contacts sought health care, and they all recovered without treatment.
该患者经RT-PCR检测对SARS-CoV-2和甲型H1N1流感均呈阳性。sars - cov - 2n基因主周期阈值(Ct)为16.1,ORF1ab主周期阈值为14.2 (Certest Biotec SL);此外，作为验证方法，SARS-CoV-2 ORF1ab基因的主Ct值为14.9,E基因的主Ct值为15.6 (cobas 6800, Roche Holding AG)。与此同时，甲型流感的主要Ct值为32.6,swFluA的主要Ct值为32.2,swwh1的主要Ct值为31.6。病例患者全血细胞计数正常，胸部CT显示清晰。
这项研究说明了埃及首例SARS-CoV-2和甲型流感(H1N1)合并感染并伴有轻度ILI症状的病例的特征，并强调了联合检测呼吸道病毒监测系统的好处。
曾有其他冠状病毒与甲型流感病毒合并感染的报告[
高热症状突发性，继发潜伏期短，病情温和，病程短，提示流感是主要病原[
埃及报告的病例为一名年轻女性，而其他国家报告的大多数患者年龄较大。在D 'Abramo等人的一篇简短评论中[
其他国家报告的合并感染病例大多病程较长，均入院治疗[
报道的合并感染病例大多存在免疫降低的易感因素，许多病例需要机械通气或ICU住院[
ILI患者检测结果显示，超过80%的病例对SARS-CoV-2和流感均呈阴性。可能需要更广泛的病毒检测来确定病因，特别是如果它会影响患者的治疗[
埃及报告了一例SARS-CoV-2和甲型流感(H1N1)合并感染病例，伴轻度伊利症状。这一发现表明，合并感染可能发生在年龄较小的人群中，没有合并症。该报告显示，患者的免疫力可以克服这两种感染，在短时间内完全康复，无需医疗程序。ILI监测被证明在检测有ILI症状的患者的病毒原因方面有效。建议扩大检测小组，特别是如果它可以指导改进病例管理准则。
全血细胞计数
中央公共卫生化验所
循环阈值
计算机断层扫描
重症监护室
流感样疾病
卫生和人口部
逆转录聚合酶链反应
没有宣布。