在埃及流感样疾病监测点发现的一名患者合并感染SARS-CoV-2和甲型流感(H1N1):病例报告

简介

COVID-19疫情

COVID-19是由SARS-CoV-2病毒引起的。截至2020年9月7日，全球共报告了27,314,629例COVID-19确诊病例和893,474例相关死亡[1］．截至2020年9月7日，埃及共报告了99,863例COVID-19确诊病例和5530例相关死亡[2］．

埃及流感样疾病监测

埃及的流感样疾病哨点监测始于2000年，分布在全国各地的8个哨点。在过去10天内出现发烧和咳嗽症状的患者被要求提供咽拭子，以保存在病毒运输介质中，储存在-80⁰C的氮罐中，并每周运送到开罗的中央公共卫生实验室(CPHL)，通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测流感类型和亚型。患者的人口统计学和临床数据收集在一个专门的数据库中，并定期进行分析。每周向决策者和相关利益攸关方提供流感阳性率以及流行流感类型和亚型的报告。

COVID-19大流行期间ILI监测计划的修改

自COVID-19大流行开始以来，埃及卫生与人口部(MoHP)要求所有政府医院的所有急性呼吸道症状患者由急诊科(ED)进行评估。因此，ILI监测小组被要求每天在急诊科登记前2例有ILI症状的患者，并遵循通常的监测方法进行数据和样本收集。卫生部要求将SARS-CoV-2纳入所有ILI监测点的检测小组。

在大流行早期，CPHL是卫生部批准进行SARS-CoV-2检测的唯一实验室。由于资源限制，从2019年10月开始暂停了流感检测，从ILI患者收集的标本在-70°C下存档，以便在可能的情况下进行后续检测。随着2020年8月埃及COVID-19患者数量开始下降，CPHL开始检测在ILI地点收集的存档标本。

研究目标

2020年8月16日，卫生健康委向卫生部监测部门通报一例新型冠状病毒与甲型H1N1流感病毒混合感染病例。本报告旨在描述如何确定病例，并描述患者的人口统计学和临床特征和结果。

方法

ILI监测方法:病例发现

2000年，埃及在全国6个省的8个门诊部实施了流感病毒学监测。对参加病毒学监测的参与者(每天2-3名ILI受试者，每周6天)进行访谈，以获取他们的人口统计信息。采用世界卫生组织ILI监测标准招募患者，包括突发性发热≥38ºC，最近10天内出现咳嗽呼吸表现[3.］．

在对常规ILI样本进行检测时，CPHL工作人员注意到一例SARS-CoV-2和甲型H1N1流感合并感染病例，经PCR检测证实。

案件调查

CPHL的工作人员联系了一名监控官员，后者通过电话调查了此案。调查了病例患者及其接触者的临床情况、病程、严重程度危险因素、其他临床调查和疾病转归。监测数据被输入卫生部的实时网络数据库，实验室数据被输入CPHL，并自动与监测数据合并。提取2019年10月至2020年8月的ILI数据，分析流感和SARS-CoV-2及其合并感染。

实验室及临床调查

从患者身上采集鼻咽拭子，使用chemagic 360仪器(PerkinElmer Inc .)对临床样本进行核酸提取。采用VIASURE SARS-CoV-2 Real-Time PCR检测试剂盒(Certest Biotec SL)检测SARS-CoV-2 RNA (ORF1ab)。按照制造商的建议进行了三次RT-PCR，使用cobas 6800系统(罗氏控股公司)确认样本对SARS-CoV-2呈阳性。此外，利用美国疾病控制中心的协议，用实时荧光定量PCR检测甲型H1N1流感[4］．对患者进行了全血细胞计数(CBC)和胸部计算机断层扫描(CT)图像。

结果

ILI监测病毒学结果

2020年2月至8月收集的510份ILI症状患者标本中，流感阳性29份(5.7%)。其中15例(51.7%)A(H1N1)阳性，11例(38.0%)A(H3N2)阳性，3例(10.3%)b型流感阳性。埃及于2月14日宣布了首例COVID-19病例，而ILI监测在2周后发现了首例COVID-19病例，宣布该疾病在埃及开始出现社区传播。在510份检测标本中，61份(12.0%)呈covid -19阳性(图1)．1例确诊病例同时感染SARS-CoV-2和甲型H1N1流感。

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案件调查结果

病例患者于2020年5月被送到为开罗半城区Helwan提供服务的ILI监测点之一的门诊。患者21岁，女学生，主诉发热、咳嗽、乏力、乏力2天，无其他症状或相关共病。患者高热40.2°C，听诊胸部通畅。患者全血细胞计数正常，胸部CT显像清晰，无下呼吸道感染。病人被擦洗后送回家治疗;给予退热药、止咳药、口服头孢氨苄2克/日对症治疗。患者症状持续2天，随后完全恢复。在家中，未对该病例患者进行隔离，其5名家庭接触者中有4人在接触确诊病例2-3天后出现轻微呼吸道症状。继发病例包括2名父母(均为49岁)和2名兄弟(9岁和16岁);除病例父亲因高血压2周后康复外，其余患者均在2-3天内康复。 None of the case patient’s contacts sought health care, and they all recovered without treatment.

实验室及临床调查结果

该患者经RT-PCR检测对SARS-CoV-2和甲型H1N1流感均呈阳性。sars - cov - 2n基因主周期阈值(Ct)为16.1,ORF1ab主周期阈值为14.2 (Certest Biotec SL);此外，作为验证方法，SARS-CoV-2 ORF1ab基因的主Ct值为14.9,E基因的主Ct值为15.6 (cobas 6800, Roche Holding AG)。与此同时，甲型流感的主要Ct值为32.6,swFluA的主要Ct值为32.2,swwh1的主要Ct值为31.6。病例患者全血细胞计数正常，胸部CT显示清晰。

讨论

SARS-CoV-2与甲型H1N1流感合并感染

这项研究说明了埃及首例SARS-CoV-2和甲型流感(H1N1)合并感染并伴有轻度ILI症状的病例的特征，并强调了联合检测呼吸道病毒监测系统的好处。

曾有其他冠状病毒与甲型流感病毒合并感染的报告[5］．在当前COVID-19大流行期间，包括中国、意大利、伊朗和日本在内的许多国家进行的案例研究报告了SARS-CoV-2和甲型H1N1流感的合并感染[6-9］．

主要病毒原因

高热症状突发性，继发潜伏期短，病情温和，病程短，提示流感是主要病原[10］．有趣的是，该患者标本的Ct值显示SARS-CoV-2感染的病毒载量远高于甲型H1N1流感。研究表明，SARS-CoV-2病毒载量在症状出现前后或几天后达到峰值[11］．这表明流感感染发生得更早，并竞争性地抑制了SARS-CoV-2的复制[12］．

埃及病例与其他国家报告的病例相比如何

人口统计资料

埃及报告的病例为一名年轻女性，而其他国家报告的大多数患者年龄较大。在D 'Abramo等人的一篇简短评论中[7]描述了37例SARS-CoV-2和流感合并感染的患者，发现66.7%的患者年龄≥50岁，其中56.5%为男性。

病程及严重程度

其他国家报告的合并感染病例大多病程较长，均入院治疗[6-10］．尽管从埃及报告的病例患者症状轻微，但她是在例行伊利监测活动中被发现的。患者病程短，在家治疗4天，CBC和胸部CT表现正常。她的隐形人症状更轻;因此，他们没有寻求任何医疗建议。

诱发因素

报道的合并感染病例大多存在免疫降低的易感因素，许多病例需要机械通气或ICU住院[6-9，13］．结果发现，60%以上的合并感染患者有合并症，33%需要人工通气，29%入住ICU。迄今为止，从埃及报告的病例是所有国家中唯一出现轻度上呼吸道症状的病例。这可能与患者的年龄和性别有关，除了没有易感合并症。

ILI患者检测结果显示，超过80%的病例对SARS-CoV-2和流感均呈阴性。可能需要更广泛的病毒检测来确定病因，特别是如果它会影响患者的治疗[13］．

结论

埃及报告了一例SARS-CoV-2和甲型流感(H1N1)合并感染病例，伴轻度伊利症状。这一发现表明，合并感染可能发生在年龄较小的人群中，没有合并症。该报告显示，患者的免疫力可以克服这两种感染，在短时间内完全康复，无需医疗程序。ILI监测被证明在检测有ILI症状的患者的病毒原因方面有效。建议扩大检测小组，特别是如果它可以指导改进病例管理准则。