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摘要

背景:

由SARS-Cov-2 (COVID-19)引起的新型冠状病毒疾病已被宣布为全球大流行，并仍在全球范围内持续蔓延。而根据政府报告和基因组多样性研究，高海拔地区整体死亡率和感染病例明显较低。探讨了影响新冠肺炎发展趋势的几个因素。然而，关于高海拔地区低感染病例的证据，以及潜在的生物学机制如何影响中国高海拔地区COVID-19聚集性感染的信息有限。

摘要目的:

本研究旨在通过分析环境因素与COVID-19确诊病例的相关性和病毒突变，探讨海拔高度对中国COVID-19聚集感染的影响。

方法:

我们首先通过线性回归检验海拔高度与COVID-19感染的相关性，并在零镜头模型中通过文本挖掘进一步确定了与COVID-19相关的几个主要因素。采用Spearman相关分析了中国高海拔地区新冠肺炎确诊病例的气象因子和空气质量之间的相关性。我们进一步确定了高海拔和低海拔地区不同的病毒突变，以及使用相同的相关技术，我们的环境因素与突变频率之间的关系。

结果:

经线性回归分析，海拔高度与中国新冠肺炎确诊病例呈负相关。Spearman相关分析表明，中国高海拔地区平均气温、日照时数、紫外线指数、风速、NO2平均浓度与日新增确诊病例呈负相关，气压、PM2.5平均浓度与日新增确诊病例呈正相关。对低海拔和高海拔人群突变多样性的进一步研究表明，与低海拔地区的300个序列相比，每个SARS-CoV-2基因组的核苷酸之间的遗传多样性更低(p < .001)和三个开放阅读框(orf) (p < .001)。进一步的相关分析表明，海拔高度、风速、大气压与温度、紫外线指数、日照时数呈负相关，且存在一些关键的非同义突变。

结论:

气象和空气质量参数等环境因子特征在很大程度上反映了中国高海拔地区新冠肺炎确诊病例较少的证据。此外，环境因素对病毒变异的影响也增加了海拔对聚集感染的影响，为预防干预提供了新的建议。