发表在10卷第11名(2022): 11月

本文的预印本(早期版本)可在https://preprints.www.mybigtv.com/preprint/40039,首次出版
展望机器学习在儿科医学中的应用:混合方法研究

展望机器学习在儿科医学中的应用:混合方法研究

展望机器学习在儿科医学中的应用:混合方法研究

原始论文

1病童医院血液学/肿瘤科,多伦多,安大略省,加拿大

2美国加州帕洛阿尔托斯坦福大学儿科血液学/肿瘤科

3.儿童健康评估科学项目,Peter Gilgan研究和学习中心,安大略省多伦多

4哥伦比亚巴兰基亚北大系统工程与计算系

5斯坦福生物医学信息研究中心,生物医学数据科学系,斯坦福大学,加州帕洛阿尔托,美国

通讯作者:

莉莉安·宋,医学博士

血液/肿瘤科

病童医院

大学大道555号

多伦多,ON, M5G1X8

加拿大

电话:1 416 813 5287

传真:1 416 813 5979

电子邮件:lillian.sung@sickkids.ca


背景:考虑到机器学习实施的成本,一个系统的方法来优先考虑将哪些模型实施到临床实践中可能是有价值的。

摘要目的:主要目标是确定在优先考虑机器学习模型实施时,2家儿科机构的受访者认为重要的医疗保健属性。次要目标是用定性方法说明他们对执行工作的看法。

方法:在这项混合方法研究中,我们向2家儿科机构的卫生系统负责人、医生和数据科学家分发了一项调查。我们要求受访者根据实施有用性对以下5个属性进行排名:临床问题是常见的,临床问题导致了大量的发病率和死亡率,风险分层导致了可以合理改善患者结果、减少医生工作量和节省资金的不同行动。重要的是那些排在第一或第二重要的品质。对受访者的子样本进行了个别定性访谈。

结果:613名合格受访者中,275人(44.9%)做出了回应。对17名受访者进行了定性访谈。最常见的重要属性是导致不同行为的风险分层(205/275,74.5%)和导致大量发病率或死亡率的临床问题(177/275,64.4%)。最不重要的因素是减少医生工作量和省钱。定性访谈始终优先考虑改善患者结果的实施。

结论:受访者优先考虑了机器学习模型的实施,因为风险分层会导致不同的行动和导致大量发病率和死亡率的临床问题。改善患者预后的实施被优先考虑。这些结果有助于为机器学习模型的实现提供一个框架。

JMIR Med Inform 2022;10(11):e40039

doi: 10.2196/40039

关键字



随着电子健康记录的广泛采用,机器学习在临床环境中越来越受欢迎[1-3.],结合数据存储和计算能力的提高[4].在这种情况下,机器学习可以用于多种目的,包括:(1)促进诊断,如在病理学中[56]及放射学[7];(2)对风险分层的结果进行预测;以及(3)通过预测病人或服务的数量来提高资源利用[8].然而,尽管人们最初对医疗保健领域的机器学习充满热情,但领域专家表示谨慎。910].类似的信息技术解决方案通常未能实施或提供效用[11].

影响效用的一个重要考虑因素是选择要实施机器学习模型的临床环境和问题[11].机器学习模型的预测需要以一种有意义和可操作的方式来增强当前的方法,而不会带来过多的负担。仔细计划机器学习模型的实现是很重要的,因为模型部署的成本是相当大的。这些成本可能包括开发和维护机器学习模型所需的资源,对预期模型用户进行关于如何访问和解释模型预测的培训,以及帮助用户将结果付诸实践的支持[1213].

考虑到这些成本,确定哪些机器学习模型应该优先用于临床实践的系统方法可能是有价值的。在确定优先事项时,重要的是让计划部署的机构的主要利益相关者参与进来。我们选择调查2个儿科中心,一个在美国,有一个更成熟的生物医学信息学项目,一个在加拿大,有一个不太成熟的生物医学信息学项目,以深入了解经验和专业知识是否影响机器学习模型优先级的偏好。因此,主要目标是确定2家儿科机构的受访者在优先考虑机器学习模型实施时的医疗保健属性。第二个目标是用定性方法描述他们对机器学习模型实现的观点。


研究设计与设置

这是一项混合方法研究,包括定量和定性成分。这些机构分别是加拿大安大略省多伦多市的病童医院(SickKids)和美国加利福尼亚州帕洛阿尔托市的露西尔·帕卡德儿童医院。

参与者

在调查分发时,我们包括SickKids和Lucile Packard儿童医院的卫生系统负责人、医生和数据科学家。我们排除了实习生。

程序

该调查是由研究团队根据受访者可能认为重要的医疗保健属性的印象制定的;以机器学习为重点的问题表示为多媒体附件1.潜在的参与者是通过组织的电子邮件列表确定的。定量调查通过电子邮件分发,参与者在REDCap完成调查[14].调查要求受访者说明他们是卫生系统领导者、医生还是数据科学家;受访者可以指出多个类别。人口统计学变量包括临床专业(如适用)、培训完成后就业年限和性别。

然后,我们用李克特量表(Likert scale) 5分制询问他们对人工智能的了解程度,范围从1(完全不了解)到5(了解很多)。我们要求他们对如何构建和解释机器学习模型,以及如何进行和解释统计数据进行评估,使用5点李克特量表,范围从1(不理解)到5(完全理解)。我们询问他们是否有在其工作环境中实施人工智能计划的决策能力,以及在过去5年里他们的机构部署了多少机器学习模型。

下一部分要求受访者根据机器学习实施是否有用,对以下5个临床问题和实施后果属性进行排名:“要解决的临床问题是常见的”,“临床问题会导致大量的发病率或死亡率”,“风险分层将导致不同的临床行动,这些行动可以合理地改善患者的结果”,“实施该模型可以减少医生的工作量”,“实施该模型可以节省资金”。重要属性被定义为受访者认为最重要或第二重要的属性(排名为1或2)。然后,调查提出了两个开放式问题,重点是能够准确预测结果可能有用的临床领域,以及优先排序或重组等待名单可能有用的临床领域。最后,调查询问他们是否愿意参加定性访谈。

在定性方面,我们特意对受访者进行抽样,以最大限度地提高机构和对机器学习的自评理解的差异。半结构化访谈使用Zoom (Zoom Video Communications, Inc.)或Microsoft Teams进行,由SickKids团队(EP)的一名成员进行定性访谈。受访者被要求列出三种情况,其中机器学习模型的风险分层可能有用,然后说明哪一种情况是首先实施的最重要的,以及选择的理由。然后,他们被问及与目前的方法相比,使用机器学习模型进行风险分层的感觉如何,并描述他们对使用机器学习模型指导患者护理的担忧。采访被逐字记录下来。

分析

来自SickKids和Lucile Packard儿童医院的定量调查数据使用Fisher精确检验进行比较。使用RStudio 3.6.1版本在R (R Core Team)中进行分析[1516].

定性数据分析依据扎根理论方法论原则进行;数据收集和分析同时进行。定性成绩单由两名独立评审员(NA和EP)使用恒定比较法进行分析,以建立一个基于受访者个人经验和理解的机器学习观点的理论框架。采样继续进行,直到达到饱和,饱和被定义为数据中没有出现新的主题。

伦理批准

这项研究得到了SickKids研究伦理委员会的批准。露西尔·帕卡德儿童医院不需要机构审查委员会的批准,因为数据收集是由SickKids人员完成的。对于定量调查,完成调查被视为隐含同意参与研究。对于定性部分,受访者提供口头同意参与。


这项定量调查于2021年11月1日至2022年1月6日在SickKids分发,并于2022年3月15日至2022年4月12日在Lucile Packard儿童医院分发。613名合格受访者中,275人(44.9%)做出了回应。图1显示参与者识别和选择流程图,包括达到饱和时参与定性访谈的人数。

表1介绍受访者的人口学特征;内科专科(P<.001)以及完成培训后的年限(P=.006),差异有统计学意义。大多数受访者是医生(病童医院165/ 195,84.6%,露西尔帕卡德儿童医院73/ 80,91.3%)。有决策能力实施人工智能计划的受访者人数在SickKids为99/195(50.8%),在Lucile Packard Children 's Hospital为41/80(51.3%)。大多数受访者不知道过去5年他们所在机构部署的机器学习模型的数量(SickKids为137/ 195,70.3%,Lucile Packard Children 's Hospital为53/ 80,66.3%)。

表2说明受访者对人工智能的自我认知以及对机器学习和统计学的理解。各机构在这些评分上没有统计学上的显著差异(人工智能知识,P= iseq指数;机器学习的发展和解释,P=标识;统计工作及解释,P= .19)。表示自己拥有“适度”或“大量”人工智能知识的受访者比例在SickKids为17.9%(35/195),在Lucile Packard Children 's Hospital为17.5%(14/80)。多媒体附件2比较了那些自认为自己的人工智能知识高(在李克特5分制量表上得分为4或5分)和不高的受访者的特征。那些自我评价自己知识水平高的人明显更有可能是男性(P=.02)和非医生(P= .006)。在SickKids医院,表示“中等”或“完全”理解机器学习开发和解释的受访者比例为15.9%(31/195),而在Lucile Packard儿童医院,这一比例为11.3%(9/80)。在这两个机构中,表示他们对机器学习理解“没有”或“很少”的比例为146/275(53.1%)。相反,表示自己“中等”或“完全”理解统计操作和解释的受访者比例在SickKids为54.4%(106/195),在Lucile Packard儿童医院为42.5%(34/80)。在这两所大学中,表示自己对统计学理解“没有”或“很少”的比例为30/275(10.9%)。

图1。CONSORT(试验报告综合标准)参与者识别、选择和参与的图表。
查看此图
表1。2个儿科机构参与者的人口学特征(N=275)。
特征 病童(n=195), n (%) 露西尔帕卡德儿童医院(n=80), n (%) P价值
男性的性别 93 (47.7) 35 (43.8) .64点
专业的作用一个



医生 165 (84.6) 73 (91.3) .20

卫生系统负责人 22日(11.3) 17 (21.3) 0。

数据科学家 15 (7.7) 2 (2.5) 只要
医生专业

<措施

血液学肿瘤 33 (16.9) 14 (17.5)

一般内科 21日(10.8) 7 (8.8)

重症监护医学 11 (5.6) 12 (15.0)

急诊医学 14 (7.2) 0 (0)

心脏病学 9 (4.6) 7 (8.8)

神经学 11 (5.6) 3 (3.8)

内分泌和代谢 10 (5.1) 6 (7.5)

胃肠病学 9 (4.6) 0 (0)

Respirology 4 (2.1) 4 (5.0)

传染性疾病 2 (1.0) 5 (6.3)

手术 0 (0) 6 (7.5)

青少年医学 6 (3.1) 0 (0)

其他 20 (10.3) 7 (8.8)

不知道 45 (23.1) 9 (11.3)
培训完成后数年

.006

<1 6 (3.1) 0 (0)

1 - 4 38 (19.5) 5 (6.3)

5 - 10 38 (19.5) 25 (31.3)

11 + 113 (57.9) 50 (62.5)
执行人工智能计划的决策能力 99 (50.8) 41 (51.3) >。
在过去5年中,在机构中部署的机器学习模型的数量

没有一个 31 (15.9) 11 (13.8)

1 7 (3.6) 6 (7.5)

2 - 4 14 (7.2) 9 (11.3)

5 - 10 2 (1.0) 1 (1.3)

11 + 4 (2.1) 0 (0)

不知道 137 (70.3) 53 (66.3)

一个受访者可能会选择一个以上的选项,因此,数字不等于100%。

表2。对人工智能知识的自评,对机器学习和统计学的理解。
区域 病童(n=195), n (%) 露西尔帕卡德儿童医院(n=80), n (%) P价值
人工智能知识

公布

没有一个 10 (5.1) 5 (6.3)

很少 67 (34.4) 30 (37.5)

一些 83 (42.6) 31 (38.8)

温和的 30 (15.4) 11 (13.8)

很多 5 (2.6) 3 (3.8)
机器学习开发和解释

开市

没有一个 44 (22.6) 18 (22.5)

很少 56 (28.7) 28日(35.0)

有些 64 (32.8) 25 (31.3)

温和的 24 (12.3) 8 (10.0)

完全 7 (3.6) 1 (1.3)
统计资料的进行及解释

.19

没有一个 4 (2.1) 1 (1.3)

很少 18 (9.2) 7 (8.8)

有些 67 (34.4) 38 (47.5)

温和的 78 (40.0) 29 (36.3)

完全 28日(14.4) 5 (6.3)

表3揭示了将每个属性列为机器学习模型优先级重要(在5个属性中排名第一或第二)的受访者的比例。在5个属性中的任何一个方面,各院校的比例均无显著差异(表3).在两个站点中,最常见的重要属性是导致不同行动的风险分层(205/275,74.5%)和临床问题导致大量发病率或死亡率(177/275,64.4%)。被认为最不重要的属性是“实施模型可以减少医生工作量”(40/ 275,14.5%)和“实施模型可以节省资金”(13/ 275,4.7%)。两所院校的重要性得分中位数也显示在表3(越低越重要)。

表3。被列为重要一个受访者对机器学习的优先级。
被认为重要的属性 病童(n=195), n (%) 露西尔帕卡德儿童医院(n=80), n (%) P价值 重要性评分中位数(IQR)b
正在解决的临床问题是普遍的 66 (33.8) 35 (43.8) 16 3 (2 - 3)
临床问题导致大量的发病率或死亡率 133 (68.2) 44 (55.0) 0。 2 (2 - 3)
风险分层将导致不同的临床行动,可以合理地改善患者的结果 145 (74.4) 60 (75.0) >。 1 (1 - 2)
该模型的实施可以减少医生的工作量 29 (14.9) 11 (13.8) .96点 4 (3 - 4)
实现这个模型可以节省资金 11 (5.6) 2 (2.5) 5 (4 - 5)

一个重要定义为就机器学习模型是否有用而言,排名最重要或第二重要的属性(排名1或2)。

b在两个机构中。

表4显示定性访谈的主题和子主题。机器学习模型实施的好处包括促进复杂场景下的决策,支持经验不足的临床医生,减少认知负荷,减少认知偏见。还有人表示,机器学习模型可以通过标准化、更有效的分类和促进精准医疗来潜在地提高护理质量。最后,机器学习模型有可能减少医生的工作量。然而,机器学习模型实施的潜在挑战包括算法偏差、缺乏透明度和信任,以及未能纳入临床专业知识。机器学习模型的实施也可能对护理质量产生不利影响,受访者谈到了评估机器学习模型实施影响的必要性。对机器学习模型实施提出的实际担忧包括将模型纳入临床工作流程的挑战,以及在机器学习模型导向的行动导致不良结果时的问责制问题。最后,确定了医生角色的不确定性。当被要求优先考虑机器学习模型实施的一个临床场景时,选择实施哪个场景的理由始终与对患者结果的影响有关:“对孩子最有利”,“主要死亡原因”和“影响可能非常严重”。

多媒体举例说明从定量调查中确定的机器学习计划可以优先考虑的临床领域的例子。

表4。从定性访谈看机器学习在儿科医学中的应用。
主题和子主题 例如报价
机器学习实现的好处

促进决策


复杂的场景 对我来说,这是一个非常令人不安的场景,一个非常复杂的孩子有很多问题,[…]]Having some kind of system which alerts physicians who are directly involved as to not any in their own domains, but in other domains’ risk would be helpful


支持缺乏经验的临床医生 嗯,你知道,我认为潜在的优势并不在于经验丰富的医生,而在于那些刚开始工作的人。只是还没有那个经验基础。


减少认知负荷 它可以减轻一些认知负荷。所以,没错。我的意思是,很多时候你会发现自己在半夜很累,有点昏昏沉沉,试图做一个决定,有点在你的大脑里来来回回。你知道,大概半个小时,我该做这个还是那个?


减少认知偏差 […]并不是说它取代了你的判断,而是补充了另一种感觉。...你的决定不是根据你的经验,而是根据成千上万的经验,计算更多的时间,看到所有的可能性,然后提出最好的前进道路。最可能的情况。并且明白这不是一个完美的预测,但它是一个更多...这就是大数据的用武之地,对吗?它真的是由真正的知识驱动的。它不是个人的看法或个人的经验,这是非常有偏见和扭曲的。

提高护理质量


规范护理 在解释指导方针和管理决策方面可能会有一些重要的人际差异,所以如果我们可以使用机器学习,这样就会减少这种情况,同时提供更准确或更好的护理。我想这会很有帮助。


更有效的分类 我觉得如果我们能够使用机器学习来进行风险分层,那么风险较高的孩子就可以更及时地获得转诊。认识到在这种特殊情况下,早期诊断和治疗确实会影响孩子的结局。我想那会很有帮助。


促进精准医疗 我的意思是,如果你看一下,看一组出生在25周的婴儿。会有个体差异,应该[…]]be detectable by machine learning or artificial intelligence. So instead of treating every baby as simply a member of the population, I can sort of drill down onto specific physiological and clinical factors for that baby, [...] get closer to the idea of personalized medicine.

减少医生工作量


为医生腾出时间 如果它真的有用,那么也许它会让我自由,去做只有我能做的事情。
挑战学习的实现

妨碍决策


算法的偏见 这一切都是关于系统内置的偏见,以及它如何学习你输入的数据,然后你如何把它取出来,以及它如何捡起我们自己的偏见,或像预先存在的偏见,是否像系统性的种族、民族或性别偏见[…]所以这对我们并没有真正的帮助。


缺乏透明度和信任 理解它在做什么:就像如果它在做我不能跟上或不理解的事情,我就不会那么相信它的观点[…]我想知道它是如何做出这个决定的,这样我就可以问问自己是否同意。


没有将临床专业知识纳入决策 我认为它就像我们在医学上拥有的所有工具一样,如果你适当地使用它,它可以是令人难以置信的强大。但如果它被用作一种,你知道,让我放弃我所有的其他技能,我只会遵循这种方向,这可能是有害的,所以我认为需要大量的思考。
我的意思是,在某种程度上它有助于预测,但我想我一直对机器学习持怀疑态度,因为生物学和人类不遵循算法,他们不遵循公式。

对护理质量的负面影响


结果评估的需要 […]looking at what the outcomes are and that we\'re actually improving patient care. So if we\'re admitting more but the outcomes are the same and the return visits are the same, then did it really matter and are we improving patient care or we just increasing cost to the system? And so, I think it needs constant evaluation, just like anything else that we do...


数据质量 当然,你知道你的结果或建议,或者如何使用机器学习总是和输入一样好,对吧?

实际问题


工作流实现的挑战 我想会有一些学习曲线。我们如何使用它?可行吗?在我的iPhone上吗?我是否需要进入某个区域,我需要多快才能得到响应,以及界面有多友好?你知道一些和我们还没见过的东西有关的东西。


问责制 目前,机器学习在临床决策规则方面的挑战是问责制部分,它只是想知道那将是什么样子。我们不责怪,你知道,实验室测试或实验室。你知道,如果我们不接电话。但现在,我认为人们会觉得,如果他们反对它,那意味着什么,我们是否必须在此基础上承认所有人或对待所有人,就像你在第一个问题上暗示的那样,这是一种可能性。所以这对提供者来说意味着什么选择忽略它还是选择在伤害发生时遵循它

医生的角色


医生角色的不确定性 另一方面,你知道,也许这也有点像,我猜有一种恐惧,医生的角色到底是什么。如果计算机在诊断方面做得更好,那么我也可以

在这项混合方法研究中,我们发现最常被列为机器学习模型实现的重要属性是风险分层,导致可以合理改善患者结果的不同行动,以及导致大量发病率或死亡率的临床问题。很少有受访者认为减少医生工作量和省钱很重要。我们还发现,尽管两家机构的生物医学信息项目建立水平不同,医疗保健体系不同,但重要属性相似。

机器学习模型实施的广泛推荐领域突出表明,考虑到开发、部署和监控机器学习模型的能力可能有限,即使在拥有成熟生物信息学项目的大型机构,也需要优先排序。这项研究很重要,因为它提供了一个框架,通过这个框架,机构领导人可以决定优先实施哪些机器学习模型。虽然我们发现改善患者结果的风险分层是最常见的重要属性,但其他考虑因素包括高风险和低风险标签所产生的行动,差异行动将改善结果的证据,以及确定风险分类的理想阈值。即使部署了模型,对模型性能的持续监测以及模型部署对患者护理和临床工作流程的影响也是实施后的额外考虑因素。

当我们评估不同受访者类型的属性重要性时,wear和Berg [11]之前讨论了决策者、机器学习解决方案的受益者和那些承担实施负担的人之间的复杂关系。他们指出,这些个体之间的不匹配可能导致失败。更具体地说,管理者往往是决策者和利益的接受者,而临床医生往往承担实施的负担[11].在确定涉众类型的优先级过程中,需要预见和承认相互冲突的观点。

我们还发现,在这两个机构中,受访者对他们对统计学的理解有更大的信心,而对他们对机器学习的理解有相对较低的信心。尽管这两所机构的生物医学信息学项目的建立水平不同,但这些观点在两所机构之间没有差异。我们的研究结果表明,在儿科医学领域,在培训和继续教育期间需要更多专注于机器学习的教育。

我们的结果补充了其他人的工作,他们强调了临床决策支持的要求,包括那些基于机器学习的工作。需要考虑的重要事项包括:除了确保相关性、尊重和科学有效性之外,还需要避免黑箱、过多的时间要求和复杂性[17-19].研究还表明,采用人工智能的障碍不仅限于临床医生,还包括父母[20.21].将我们的研究结果与儿科医学以外的研究进行比较也可能是有用的。我们发现,实施机器学习的主要预期好处是促进决策、提高护理质量和减少医生工作量。与我们的发现相比,与人工智能相关的好处和挑战在眼科、皮肤科、放射科、验光和外科都是相似的[2223].然而,我们的研究是独特的,因为我们考虑了如何优先考虑实施的问题,这是开发临床项目时的一个务实的考虑。此外,对儿科的关注可能很重要,因为临床问题的性质、观点和利益相关者在儿科和成人患者群体之间可能有所不同。

本研究的优势包括其混合方法设计和按国家纳入2个不同的儿科机构,并建立其生物医学信息计划。然而,我们的结果应该根据它们的局限性来解释。我们的回复率相对较低;受访者可能偏向于对机器学习感兴趣。因此,非受访者可能对机器学习的熟悉程度较低,并且可能对机器学习优先级的重要属性没有强烈的意见。医生的比例也高于系统领导者或数据科学家的比例;这些组可能有不同的优先级或实现关注点。

总之,受访者优先考虑了机器学习模型的实施,因为风险分层会导致不同的行动和导致大量发病率和死亡率的临床问题。改善患者预后的实施被优先考虑。这些结果可以帮助提供一个优先考虑机器学习模型实现的框架。

致谢

LS得到了加拿大儿科肿瘤学研究主席的支持

利益冲突

没有宣布。

多媒体附件1

定量调查。

DOCX文件,16kb

多媒体附件2

人工智能知识高与不高的参与者的比较(N=275)。

DOCX文件,17kb

多媒体

从定量调查中得出的儿科护理中机器学习应优先考虑的领域的建议示例。

DOCX文件,18kb

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C·洛维斯编辑;提交02.06.22;S Ramgopal, H Hochheiser同行评审;作者评论07.09.22;修订版本收到15.09.22;接受10.10.22;发表17.11.22

版权

©Natasha Alexander, Catherine Aftandilian, Lin Lawrence Guo, Erin Plenert, Jose Posada, Jason Fries, Scott Fleming, Alistair Johnson, Nigam Shah, Lillian Sung。最初发表在JMIR医学信息学(https://medinform.www.mybigtv.com), 17.11.2022。

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