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新型冠状病毒Delta变种给东南亚国家带来了前所未有的挑战。由于各国在此过程中采取了不同的公共卫生干预措施,其传播在东南亚表现出空间异质性。因此,公共卫生当局必须发现疫情进展与相应干预措施之间的潜在联系,以便制定集体和协调的控制措施,以提高其在减少SEA传播方面的有效性。
本研究的目的是探讨COVID-19 Delta变异的时空进展与SEA非药物干预(NPI)措施之间的潜在联系。我们检测了COVID-19暴发的时空聚类,并分析了NPI测量方法与COVID-19传播的关系。
我们收集了2021年6月1日至10月31日区级每日新冠肺炎病例,以及东南亚地区区级人口数据。我们采用前瞻性时空扫描统计量来识别时空聚类。利用累积前瞻性时空扫描统计数据,我们进一步确定了每个地区在半个月间隔内的相对风险(RR)变化及其潜在的公共卫生干预联系。
我们在2021年6月至8月期间在马来西亚、菲律宾、泰国、越南和印度尼西亚发现了7个COVID-19传播高危聚类(1-7群),RR为5.45 (
对时空聚类和地区rr的分析有利于公共卫生当局使用实时数据持续监测COVID-19动态。在所有东南亚国家之间进行国际协调,采取更加同步的干预措施,可能在减缓COVID-19的进展方面发挥关键作用。
COVID-19是由SARS-CoV-2引起的全球性流行病。SARS-CoV-2传染性很强,很容易通过接触、飞沫、空气、污染物等传播方式在人类、动物和环境中传播[
随着COVID-19疫情的爆发,东南亚国家在卫生和社会护理系统、旅游、贸易和服务业方面面临前所未有的挑战。
时空分析被广泛应用于COVID-19传播研究,以揭示COVID-19的空间传播特征和机制。它可以为公共卫生当局提供有关大流行的重要信息,以便在这种情况下更好地管理[
由于不同国家在病毒传播过程中采取了不同的干预措施,三角洲变异在东南亚的传播表现出显著的空间异质性。因此,本文旨在识别SARS-CoV-2 Delta变种在SEA引起的COVID-19暴发的时空聚类。我们利用7个SEA国家2021年6月至10月的地区尺度每日确诊病例,确定了活跃和新出现的聚集性疾病,并总结了相关政策,以调查政府干预措施与大流行进展之间的潜在联系。我们的工作将有助于东南亚地区COVID-19进展的区域监测,并为公共卫生部门提供有关COVID-19传播的基本信息,有助于根据COVID-19的动态情况及时制定政策。
我们的研究重点是SEA中的COVID-19 Delta变体。受限于相关数据的可用性,我们只能纳入7个国家,即(1)印度尼西亚、(2)马来西亚、(3)菲律宾、(4)新加坡、(5)泰国、(6)越南和(7)文莱,因为它们披露了地区层面的每日确诊病例数据。在Delta变种引起的第二次COVID-19疫情期间,不同国家在这一过程中实施的干预措施可能导致了传播的波动。例如,泰国、新加坡、马来西亚、菲律宾和越南在2021年8月左右开始放松限制,这可能导致大流行模式发生重大变化(
策略性环评的主要公共卫生干预措施a、b.
持续时间 | 干预措施 | |
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2021年6月1日至14日 | 微社区活动限制( |
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2021年6月14日至28日 | 社区活动限制(即PPKM)延长 |
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2021年7月2日至20日 | 在爪哇和巴厘实行紧急公共活动限制 |
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2021年7月7日至9月20日 | PPKM扩展覆盖全国 |
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2021年8月31日至9月6日 | 放宽COVID-19限制 |
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2021年9月7日至10月31日 | 爪哇大部分地区放宽了对游客的COVID-19限制 |
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2021年10月5日至18日 | 爪哇和巴厘岛的社区限制扩大 |
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2021年10月19日至31日 | 雅加达和坦格朗的PPKM限制放宽至2级 |
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2021年7月17日至9月30日 | 全国进入紧急状态 |
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2021年8月1日至31日 | 实施了更严格的限制,包括旅行限制、宵禁和来自其他地区的旅行 |
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2021年8月16日至30日 | 封锁措施延长了两周 |
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2021年8月23日至10月31日 | 通过放松一些限制,逐步向接种疫苗的游客重新开放边境,该国的战略转变为“学会与COVID-19共存” |
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2021年9月1日至10月31日 | 往返曼谷和其他高风险地区的国内航班获准恢复 |
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2021年10月1日至31日 | 深红色省份(风险最高地区)的限制放宽 |
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2021年10月16日至31日 | 宵禁缩短 |
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2021年6月21日至7月22日 | 恢复室内用餐 |
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2021年7月22日至8月8日 | 恢复到2级(高度警戒)状态,加强了限制措施,包括将社交聚会限制在2人以内,禁止室内和室外用餐 |
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2021年8月8日至9月27日 | 对完全接种疫苗的人的限制放宽了 |
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2021年8月19日至9月27日 | 员工可以回到办公室 |
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2021年8月20日至10月31日 | 边境限制放宽 |
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2021年9月14日至10月31日 | 全国疫苗接种活动进一步加强 |
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2021年9月27日至10月31日 | 个人聚会限制在5至2人,但对完全接种疫苗的人的边境限制进一步放宽 |
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2021年6月1日至28日 | 全国实施封城 |
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2021年7月3日至9月14日 | 吉兰丹州、彭亨州、霹雳州、槟城和登嘉楼的封锁放松 |
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2021年8月1日至10月31日 | 延长国家紧急状态结束 |
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2021年8月2日至9月14日 | 槟城、沙捞越和纳闽的限制进一步放松 |
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2021年8月8日至9月14日 | 8个州对完全接种疫苗的人放宽了一些限制 |
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2021年8月21日至9月14日 | 对接种疫苗的人放松了户外运动和亲自用餐的社交距离 |
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2021年9月10日至14日 | 吉隆坡、雪兰莪和布城的旅行、餐饮和旅游限制放宽 |
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2021年9月9日至10月31日 | 创意产业重新开放 |
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2021年9月14日至10月1日 | COVID-19封锁措施进一步放松 |
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2021年10月1日至31日 | 放宽行动限制 |
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2021年6月1日至30日 | 来自印度和其他6个国家的入境旅客的旅行限制延长 |
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2021年6月29日至7月15日 | 首都和周边省份的行动限制扩大 |
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2021年7月25日至31日 | 来自马来西亚和泰国的旅行暂停,马尼拉地区的限制加强 |
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2021年8月13日至31日 | 对来自印度、巴基斯坦、孟加拉国、斯里兰卡、尼泊尔、阿联酋、阿曼、泰国、马来西亚和印度尼西亚的游客的禁令延长 |
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2021年8月6日至20日 | 马尼拉大都会恢复了最严格的封锁 |
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2021年8月21日至31日 | 马尼拉首都地区放松了COVID-19限制 |
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2021年9月7日至15日 | 马尼拉的行动限制扩大 |
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2021年9月16日至10月1日 | 尽管世界卫生组织(世卫组织)直接警告不要重新开放某些企业,但马尼拉放宽了大范围的限制 |
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2021年10月1日至31日 | 马尼拉首都地区的行动限制有所放松 |
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2021年10月13日至31日 | 马尼拉大都会的宵禁时间缩短 |
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2021年10月16日至31日 | 首都地区的警戒级别从4级降至3级 |
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2021年6月14日至30日 | 胡志明市扩大了社会距离措施 |
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2021年7月7日至21日 | 胡志明市实施为期两周的封锁 |
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2021年7月18日至8月1日 | 南方16个省份实施了为期两周的封锁 |
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2021年8月15日至9月15日 | 胡志明市延长了保持社交距离的要求 |
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2021年9月16日至30日 | 胡志明市延长了COVID-19限制 |
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2021年9月23日至10月31日 | 几个省份放松了封锁限制 |
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2021年10月1日至31日 | 胡志明市部分经济活动恢复 |
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2021年10月13日至31日 | 胡志明市与附近省份之间的长途汽车恢复运营 |
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2021年10月15日至31日 | 胡志明市的风险水平降低 |
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2021年8月8日至10月3日 | 实施COVID-19限制措施 |
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2021年9月1日至15日 | 往返印度、尼泊尔、斯里兰卡、巴基斯坦和孟加拉国的旅行限制延长 |
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2021年10月4日至17日 | 行动限制收紧 |
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2021年10月13日至31日 | 夜间宵禁延长 |
一个海:东南亚。
b请注意,截至2021年10月31日,一些干预措施仍然持续有效。因此,我们将这些干预持续时间的结束日期定义为我们研究期的最后一天。
我们从7个国家的公共卫生当局的官方网站和约翰霍普金斯大学系统科学与工程中心的GIS仪表盘(
收集的数据及其来源。
国家 | 案例来源 | 人口来源 |
印尼 | KAWALCOVID19和国家确诊病例发展委员会[ |
印度尼西亚统计局[ |
马来西亚 | 马来西亚COVID-19疫情的官方数据[ |
马来西亚统计局[ |
菲律宾 | 菲律宾卫生署[ |
菲律宾统计当局[ |
新加坡 | 新加坡卫生部[ |
新加坡统计局[ |
泰国 | 卫生部疾病控制司情况报告[ |
泰国国家统计局[ |
文莱 | 约翰霍普金斯大学系统科学与工程中心COVID-19数据[ |
经济规划及统计处[ |
越南 | 越南卫生部[ |
越南统计总局[ |
在7个国家发现了Delta变种。
国家 | 第一例确诊的三角洲变种病例 |
印尼 | 2021年3月 |
泰国 | 2021年5月 |
新加坡 | 2021年4月 |
马来西亚 | 2021年5月 |
菲律宾 | 2021年5月 |
越南 | 2021年4月 |
文莱 | 2021年8月 |
2021年1月1日至10月31日,东南亚地区每日新增确诊病例。
为了探索东南亚地区新冠肺炎病例出现和活跃的时空聚集性,我们使用SaTScan 9.6版本进行前瞻性时空扫描统计分析[
我们假设COVID-19病例根据SEA研究单位的总体遵循泊松分布。零假设(
在哪里
采用最大似然比检验来评估原假设和备选假设。它确定了扫描窗口具有较高的COVID-19风险,其定义由公式(2)[
在哪里
假设同一聚类内不同地区COVID-19的相对风险(RR)相同。为使结果更加合理,我们计算了聚类内各研究单元的RR,探讨COVID-19 RR的空间异质性,如式(3)所示[
在哪里
以下部分揭示了2021年6月1日至10月31日期间东南亚7个国家新出现的重大COVID-19病例聚集性。考虑到一些东南亚国家(如马来西亚、菲律宾、新加坡、泰国)从2021年8月开始放松限制,同时加强疫苗接种计划,我们将时间轴分为两部分(即2021年6月1日至8月31日和2021年6月1日至10月31日),以确定聚集性疫情的动态。此外,我们还探讨了每个地区每半个月的RR变化,这大约等于一种感染的潜伏期[
如
2021年6月1日至8月31日COVID-19时空聚类。
集群 | 时间(天) | 地区总数N |
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观察到的 | 预期 | RR一个 | 地区(RR>1), n (%) |
1 | 7月17日至8月31日 | 47 | <措施 | 1246176年 | 278375 .06点 | 5.45b | 39 (83) |
2 | 7月18日至8月31日 | 2 | <措施 | 300418年 | 55874点 | 5.62b | 2 (100) |
3. | 7月17日至8月31日 | 30. | <措施 | 6335 | 223562 .03点 | 0.03 | 0 |
4 | 7月22日至8月31日 | 6 | <措施 | 184097年 | 53834 .73点 | 3.50b | 4 (67) |
5 | 8月11-31 | 3. | <措施 | 196693年 | 87355 .91点 | 2.30b | 3 (100) |
6 | 7月17日至8月31日 | 1(雅加达) | <措施 | 123567年 | 52481 .33 | 2.38b | 1 (100) |
7 | 7月17日至8月31日 | 1 (DIYc) | <措施 | 62476年 | 18229 .28点 | 3.45b | 1 (100) |
8 | 8月7-31 | 3. | <措施 | 24861年 | 79338 .99 | 0.31 | 0 |
9 | 8月7-31 | 1(贾瓦巴拉特) | <措施 | 59194年 | 130362 .28点 | 0.45 | 0 |
10 | 7月17日至8月31日 | 11 | <措施 | 158665年 | 259719 .07点 | 0.60 | 2 (18) |
11 | 8月18-31 | 1(爪哇腾迦) | <措施 | 15132年 | 55221 .58 | 0.27 | 0 |
12 | 8月15-31 | 1(爪哇帖木儿) | <措施 | 26939年 | 74674 .85 | 0.36 | 0 |
13 | 8月15-31 | 4 | <措施 | 18415年 | 41030 .60 | 0.45 | 0 |
14 | 7月22日至8月31日 | 14 | <措施 | 82443年 | 60927 .09点 | 1.36b | 11 (79) |
一个相对风险。
b高风险的集群。
cDIY: Daerah Istimewa Yogyakarta。
2021年6月1日- 8月31日COVID-19时空聚类的空间分布相对风险。
从2021年6月1日到10月31日,总共检测到11个重要的星团,比早期减少了3个。在11个聚类中,高危聚类(RR>1)仅为4个(36%),较前一期的7个(
2021年6月1日至10月31日COVID-19时空聚类。
集群 | 时间(天) | 地区总数N |
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观察到的 | 预期 | RR一个 | 地区(RR>1), n (%) |
1 | 8月17日至10月31日 | 47 | <措施 | 1441175年 | 421090 .26 | 3.91b | 45 (96) |
2 | 8月17日至10月31日 | 2 | <措施 | 456029年 | 86398 .28点 | 5.52b | 2 (100) |
3. | 8月17日至10月31日 | 33 | <措施 | 13724年 | 355228 .49点 | 0.04 | 0 |
4 | 8月28日至10月31日 | 4 | <措施 | 34492年 | 357601 | 0.09 | 4 (100) |
5 | 8月27日- 10月31日 | 1(贾瓦巴拉特) | <措施 | 19419年 | 315097 .51 | 0.06 | 0 |
6 | 8月27日- 10月31日 | 8 | <措施 | 37326年 | 342621 .73点 | 0.11 | 0 |
7 | 8月17日至10月31日 | 5 | <措施 | 283690年 | 63058 .92点 | 4.62b | 4 (80) |
8 | 8月21日- 10月31日 | 1(爪哇腾迦) | <措施 | 24989年 | 260017 .41点 | 0.09 | 0 |
9 | 8月17日至10月31日 | 6 | <措施 | 728003年 | 366113 .53点 | 2.08b | 6 (100) |
10 | 9月3日- 10月31日 | 8 | <措施 | 17783年 | 145558 .63点 | 0.12 | 0 |
11 | 10月4-31 | 10 | <措施 | 60614年 | 136535 .58 | 0.44 | 0 |
一个相对风险。
b高风险的集群。
2021年6月1日- 10月31日COVID-19时空聚类的空间分布相对风险。
具体而言,印度尼西亚所有地区都观察到不同程度的RR下降。虽然印度尼西亚大部分地区的RR略有下降0.05-0.5,但其余5个地区(雅加达、DIY、加里曼丹·乌达拉、加里曼丹·帖木儿和Kepulauan Riau)的RR下降较为明显(≤-0.5),其中印尼首都雅加达的差异最大(-1.4)。请注意,雅加达是第二次疫情早期的主要新兴风险区之一,直到我们的研究期结束,它仍面临相对较高的RR(2.79)。相反,菲律宾所有地区的RR在两次疫情爆发期间都有所上升,表明COVID-19的风险影响总体恶化。幸运的是,在菲律宾的17个地区中,有14个(82%)出现小幅增长(≤0.5)。其他3个地区,即国家首都地区、第二地区和科迪勒拉行政区,从0.59上升到1.23。同时,没有观察到显著的增加(>1.5),说明最严重的RR变化并没有发生在菲律宾。
相比之下,新加坡、马来西亚、文莱、泰国、越南等其他国家在不同的地区表现出不同的RR变化,泰国77个地区中约有一半(n= 39,51%) RR上升,一半下降。很明显,该国南部沿海地区比中部、东部和北部地区的内陆地区面临更高的RR。越南几乎所有地区的RR略有变化,范围在-0.08至0.28之间,但3个相连城市除外(即同奈:0.63,胡志明市:0.72,平阳:1.73)。至于马来西亚,16个地区中有10个(63%)的RR出现上升,占该国的主要比例。纳闽和吉隆坡在东南亚地区的下降最为明显。值得注意的是,在研究早期,这些地区也是受COVID-19风险威胁最严重的地区(RR>10),并且在研究结束前,这些地区在SEA中的RR相对最高。此外,新加坡的RR上升至1.43。文莱的RR也有所上升,但仍低于1。
2019冠状病毒病相对风险(RR)在两个时期(2021年6月1日至8月31日和6月1日至10月31日)的变化(地区水平)。
此外,我们以半个月为间隔检测到RR的进展,并使用10个间隔的总和来说明Delta变体从2021年6月至10月的进展(
东南亚COVID-19 RR进展的空间格局(2021年6月1日至15日和6月1日至30日)。RR:相对风险;海:东南亚。
东南亚COVID-19 RR进展的空间格局(2021年6月1日至7月15日和6月1日至7月31日)。RR:相对风险;海:东南亚。
东南亚地区COVID-19 RR进展的空间格局(2021年6月1日至8月15日和6月1日至8月31日)。RR:相对风险;海:东南亚。
东南亚地区COVID-19 RR进展的空间格局(2021年6月1日至9月15日和6月1日至9月30日)。RR:相对风险;海:东南亚。
东南亚COVID-19 RR进展的空间格局(2021年6月1日至10月15日和6月1日至10月31日)。RR:相对风险;海:东南亚。
在本研究中,我们利用前瞻性时空扫描统计数据来检测SEA中新出现和现有的COVID-19时空聚类。我们发现,马来西亚和菲律宾的大部分地区、越南的胡志明市和平阳、泰国的首都及其周边地区以及印度尼西亚在早期(2021年6月至8月)表现出较高的COVID-19传播风险。2021年8月以后,时空聚类和区域RR随各国政府干预力度的变化而变化。在整个研究期间,印度尼西亚降低了大流行传播的风险。这可能归因于实现和扩展的
在大多数限制措施不一致的国家,RR在放松限制后出现了上升。例如,菲律宾实施了边境和流动限制,包括最严格的封锁和在线教学,这些措施成功地缓解了2021年6月至8月期间的大流行肺炎疫情。相比之下,马尼拉首都地区从2021年8月21日至31日暂时放宽了流动限制;餐馆和教堂重新开张;并从2021年9月15日起取代了大规模的冠状病毒限制。研究结果表明,此后菲律宾首都地区风险系数逐渐升高,菲律宾地区风险逐渐加剧的情况应引起持续关注。特别是,胡志明市虽然具体实施了封锁、宵禁、保持社会距离等一系列规定和限制,但总体症状仍在恶化。这可能与三角洲变异的高传染性和胡志明市超负荷的医疗保健系统有关[
据我们所知,这是首次尝试使用前瞻性时空扫描统计数据来探索SEA地区COVID-19 Delta变种疫情的时空进展,并总结疫情动态与公共卫生干预措施之间的潜在联系。既往研究采用时间序列预测模型和改进的易感暴露感染和康复模型(SEIR)等方法研究COVID-19传播风险[
此外,已有研究表明,新冠病毒的传播受多种因素的影响。例如,人口密度、人口流动和环境因素已被证明对COVID-19的传播有积极影响[
公共卫生干预在疫情防控中发挥着重要作用,其中社会限制政策有效减缓了COVID-19的传播[
自2021年8月起,考虑到国内社会经济状况,大多数东南亚国家逐步将战略从消除病例转变为与COVID-19共存[
国际协调在应对这一大流行病方面也发挥着重要作用。这包括信息共享、疫苗捐赠、医疗支持和行业合作[
尽管我们的研究有这些见解,但COVID-19数据仍有明显的局限性。首先,12个国家中只有7个国家提供了主要行政区级别的数据,因此我们无法探索SEA中完整的传播过程。事实上,许多先前的研究也面临着可用数据的短缺或丢失(即儿科数据不足)[
前瞻性时空扫描统计数据揭示了公共卫生干预措施与COVID-19 Delta变异传播风险之间的潜在联系。在持续采取严格限制措施的地区,大流行发展的风险有所下降,而一些采取宽松干预措施的国家则显示出相对较高的风险。此外,我们的方法可用于利用最新数据监测COVID-19的动态,并支持及时调整国内和区域间公共卫生干预措施,以防止大流行形势进一步恶化。
Daerah Istimewa日惹
药物干预
Pemberlakuan Pembatasan Kegiatan Masyarakat
相对风险
东南亚
本研究部分由新加坡国立大学创业基金(#A-0003623-00-00)资助。
没有宣布。