JPH 公共卫生监测 公共卫生和监测 2369 - 2960 卡塔尔世界杯8强波胆分析 加拿大多伦多 v8i7e35276 35544426 10.2196/35276 短论文 短论文 前100版《CDC COVID-19科学更新:内容分析》中预印本的出版和影响 布拉德利 希瑟 阿内森 斯泰西 黛安 Mircheva Iskra Otridge 杰里米 英航 1
疾病控制和预防中心 柯夫顿道1600号 亚特兰大,佐治亚州,30329 美国 1 2406874849 jeremy.otridge@gmail.com
https://orcid.org/0000-0001-6219-2069
奥格登 辛西娅·L 博士学位 1 https://orcid.org/0000-0003-1147-7157 伯恩斯坦 凯尔T 马斯博士 1 https://orcid.org/0000-0001-8455-899X Knuth 玛莎 信息学硕士学历 1 https://orcid.org/0000-0003-4264-1642 菲什曼 朱莉 英里每小时 1 https://orcid.org/0000-0003-3786-0605 布鲁克斯 约翰T 医学博士 1 https://orcid.org/0000-0002-2399-3389
疾病控制和预防中心 亚特兰大,乔治亚州 美国 通讯作者:Jeremy Otridge jeremy.otridge@gmail.com 7 2022 15 7 2022 8 7 e35276 29 11 2021 24 2 2022 1 3. 2022 10 5 2022 ©Jeremy Otridge, Cynthia L Ogden, Kyle T Bernstein, Martha Knuth, Julie Fishman, John T Brooks。最初发表于JMIR公共卫生与监测(https://publichealth.www.mybigtv.com), 2022年7月15日。 2022

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背景

预印本是公开发布到各种服务器上的手稿,没有经过同行评审。尽管自1961年以来就存在预印本,但由于需要即时的相关信息,在2019冠状病毒病大流行期间,预印本越来越受欢迎。

客观的

本研究旨在评估美国疾病控制与预防中心(CDC) 2019冠状病毒病科学更新(COVID-19 Science Update)预印本的发表率和影响力,并评估2019冠状病毒病科学更新团队在选择有影响力的预印本方面的表现。

方法

《科学更新》前100版(2020年4月1日至2021年7月30日)的所有预印本都被纳入研究。未发表的预印本被归类为“未发表的预印本”。随后发表的预印本有两个版本(在同行评议的期刊上和在原始预印本服务器上),分别被分析并分别称为“同行评议预印本”和“原始预印本”。发表时间是指预印本第一次发布的日期和它第一次作为同行评议文章可用的日期之间的时间间隔。2021年8月6日,所有可用稿件的影响通过Altmetric注意力评分和被引次数进行量化。通过发布状态、发布率、预印本服务器和发布时间对预印本进行分析。

结果

在研究期间纳入CDC COVID-19科学更新的275份预印本中,大多数来自三个服务器:medRxiv (n=201, 73.1%)、bioRxiv (n=41, 14.9%)和SSRN (n=25, 9.1%), 8份(2.9%)来自其他来源。另外,152篇(55.3%)最终发表。中位发表时间为2.3 (IQR为1.4-3.7)。如果排除最近2.3个月的预印本(考虑到出版时间),出版率为67.8%。此外,76种期刊至少发表了一篇CDC COVID-19科学更新的预印本,18种期刊至少发表了三篇预印本。未发表预印本(n=123, 44.7%)的中位数Altmetric Attention Score为146 (IQR 22-552),中位数被引次数为2 (IQR 0-8);原始预印本(n=152, 55.2%)分别为212 (IQR 22 ~ 1164)和14 (IQR 2 ~ 40);对于同行评审预印本,这些值分别为265 (IQR 29-1896)和19 (IQR 3-101)。

结论

先前对COVID-19预印本的研究发现,出版率在5.4%至21.1%之间。包含在CDC COVID-19科学更新中的预印本的发布率高于整体COVID-19预印本,最终发布的预印本在几个月内发布,获得的关注分数高于未发布的预印本。这些发现表明,Science Update选择预印本的过程在其发表的可能性和影响方面具有很高的保真度。将高质量预印本纳入疾病预防控制中心2019冠状病毒病科学更新,可提高这一活动为有意义的公共卫生决策提供信息的能力。

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介绍

预印本是公开的,非同行评审的文章发布在各种服务器上,如medRXiv和bioRxiv。1961年,预印本作为信息交换组首次出现。然而,由于期刊的抵制,信息交流小组于1967年关闭[ 1]。1991年,建立了一个自动电子邮件服务器,后来成为arXiv,一个流行的现代预印本服务器[ 1]。2019年,冷泉港实验室与耶鲁大学合作推出medRxiv [ 1]。在2019冠状病毒病大流行期间,由于需要快速、相关的信息来应对大流行,预印本获得了普及和可信度。为了帮助公共卫生应对COVID-19,疾病控制和预防中心(CDC)创建了COVID-19科学更新[ 2]。

《COVID-19科学更新》提供了与COVID-19相关的新文章的简要摘要,主题包括卫生公平、疫苗、变异、自然史和检测等[ 2]。为了提供最相关和及时的信息,《2019冠状病毒病科学更新》包括已发表(同行评审)的文章和手稿预印本。与世界卫生组织(世卫组织)合作,斯蒂芬·b·塞克尔疾病预防控制中心图书馆每天对所有与COVID-19相关的文章进行系统的(详尽的、可重复的和可辩护的)搜索,然后对这些文章进行清理和重复删除,以纳入世卫组织COVID-19数据库。创建该数据库的完整搜索策略可在世卫组织COVID-19数据库网站上找到[ 3.]。生成的文章将发送给CDC COVID-19应对内的科学更新团队,然后由该团队选择有关CDC COVID-19科学议程中公共卫生重点主题的同行评审文章和预印本[ 4]和CDC COVID-19应对卫生公平战略[ 5]。

《2019冠状病毒病科学更新》自2020年4月起试行每两周发布一期,自2020年9月起公开发布(以前的版本已追溯发布在互联网上)[ 2]。2020年11月,每周公开发布,并于2021年2月提供电子邮件订阅。本分析的目的是评估发表率(预印本在同行评议期刊上发表的百分比)和影响(如Altmetric注意力评分[ 6]和引用计数),以评估2019冠状病毒病科学更新团队在选择有影响力的预印本方面的表现。

方法

《2019冠状病毒病科学更新》前100版(2020年4月1日至2021年7月30日)的所有预印本均纳入本分析。一些预印本最终出版了(被归类为“同行评议预印本”),而另一些则没有出版(被归类为“未出版预印本”)。发表时间是指预印本第一次发布的日期和它第一次作为同行评议文章可用的日期之间的时间间隔。2021年8月6日,使用Altmetric注意力评分(来自学术、新闻和社交媒体来源的加权关注指标)和引用数(也来自Altmetric)对所有可用文章(同行评审与否)进行量化(中位数和四分位数范围)。对于同行评审的预印本,影响指标仅衡量出版后积累的影响。为了给预印本的出版留出时间并积累影响,我们限制了对《2019冠状病毒病科学更新》2020年版(至第70版)中包含的项目的比较。统计学比较(心境中位数检验)在Minitab与 P<。0.05为统计学显著性。通过发布状态、发布率、预印本服务器和发布时间对预印本进行分析。

结果

在分析期间《COVID-19科学更新》的1971篇文章中,275篇(14%)是预印本( 图1),其中大部分来自以下3个服务器之一:medRxiv (n=201, 73.1%)、bioRxiv (n=41, 14.9%)或带有SSRN的Lancet预印本(n=25, 9.1%),另有8篇(2.9%)来自其他来源。超过一半(152/275,55.3%)在分析期间(2020年4月1日至2021年8月6日)发表。中位发表时间为2.3个月(IQR为1.4-3.7)。如果排除最近2.3个月的预印本(考虑到出版时间),发表率为67.8%(143/211)。《2019冠状病毒病科学更新》中的预印本发表在76种不同的期刊上,18种期刊至少发表了3种。2种期刊(《新英格兰医学与临床传染病杂志》)各发表了11份预印本。

纳入《COVID-19 Science Update》的同行评议文章(n=1696)的Altmetric注意力得分中位数为365 (IQR 64-1316),引用数中位数为33 (IQR 9-111) ( 表1)。对于同行评议的预印本(n=152), Altmetric Attention Score的中位数为265 (IQR 29-1896),引文数的中位数为19 (IQR 3-101)。对于未发表的预印本(n=123), Altmetric Attention Score的中位数为146 (IQR 22-552),引文数的中位数为2 (IQR 0-8)。

为了考虑到文章公开发布时间的差异,分析样本仅限于2020年版《COVID-19科学更新》(至第70版; 表1)。73份预印本中,已发表50份(68.4%)。已发表文章的中位数Altmetric注意力得分(328,IQR 57-1224)高于未发表的预印本(83,IQR 9-231; P= .002)。同行评议(260,IQR 43-1817)和未发表的预印本在Altmetric Attention Score上的差异没有统计学意义,可能是由于样本量小( P= .09点)。同行评议预印本(55篇,IQR 9-148)和已发表文章(43篇,IQR 15-149)的引用中位数明显更高 (P<.001)比未发表的预印本(4,IQR 1-9)。经同行评审的预印本与已发表的论文( P= 23)。

美国疾病控制与预防中心(CDC)《2019冠状病毒病科学更新》前100期(2020年4月至2021年7月)收录的文章类型细目。左边的饼图显示预印本和已发表文章的总数。右边的饼显示了截至2021年8月6日,左边的饼中有多少预印本被同行评审或未发表。

截至2021年8月6日,美国疾病控制与预防中心(CDC)《2019冠状病毒病科学更新》前100版(2020年4月至2021年7月)中包含的文章和预印本的中位数Altmetric注意力得分和引用数。

文章类型 物品,n (%) 中位数另类注意分数(IQR) 引文中位数,n (IQR)
版本1 - 100
总计 1971 324 (56 - 1249) 28日(7 - 93)
发表 1696 (86) 365年(64 - 1316) 33 (9 - 111)
预印本 275 (14) 174 (22 - 899) 6(1至29)
同行评议一个 152 (8) 265 (29 - 1896) 19 (3 - 101)
未发表的 123 (6) 146 (22 - 552) 2(主)
1-70版(2020年),考虑到时间积累的影响
总计 1213 312 (55 - 1194) 43 (14 - 147)
发表 1140 (94) 328 (57 - 1224)b 43 (15 - 149)b
预印本 73 (6) 150 (25 - 866) 15 (4 - 72)
同行评议一个 50 (4) 260 (43 - 1817) 55 (9 - 148)b
未发表的 23日(2) 83 (9 - 231) 4 (1 - 9)

一个这些论文存在两种版本:保留在预印本服务器上的原始预印本和发表在期刊上的同行评审版本

b P<。Altmetric注意力评分或未发表预印本的引用计数差异为05。仅对版本1-70的文章进行了测试,以说明文章必须积累影响的时间差异。

讨论

先前对COVID-19预印本的分析发现,发表率在5.7%至21.1%之间[ 7 8]。《2019冠状病毒病科学更新》中预印本的发布率高于其他地方的报道[ 7 8],最终发表的论文比未发表的预印本获得了更高的关注分数。Altmetric关注得分高仅表示出版物获得的总关注。它不区分积极和消极的注意力,所以一个高的Altmetric注意力评分可以同样反映高科学价值的出版物或被广泛驳斥的出版物[ 6]。预印本有助于快速获取信息;然而,它们最终受到缺乏同行评审的限制,因此可能会发生变化,甚至可能永远不会发表。因此,辨别有影响的高质量预印本的能力是公共卫生决策的重要工具。尽管存在这些局限性,但我们的分析结果表明,用于选择预印本的COVID-19 Science Update流程是稳健的,在预印本发表的可能性和影响力方面具有高保真度。将高质量预印本纳入《2019冠状病毒病科学更新》可提高这一活动提供及时信息的能力,这可能对有意义的公共卫生决策产生影响。

缩写 疾病预防控制中心

疾病控制和预防中心

世界卫生组织

该项目得到了美国能源部和疾病控制与预防中心(CDC)的研究参与计划(JO)的部分支持,该计划由橡树岭科学与教育研究所通过美国能源部和CDC之间的机构间协议管理。作者要感谢疾病预防控制中心COVID-19应对首席医疗官办公室内的科学更新团队。

免责声明

本报告中的发现和结论是作者的发现和结论,并不一定代表疾病控制和预防中心的官方立场。

除了JO之外,所有作者都是美国政府雇员(CDC),她是CDC图书馆科学办公室的ORISE研究员。

科布 生物学的史前预印本:20世纪60年代一个被遗忘的实验 公共科学图书馆杂志 2017 11 16 15 11 e2003995 10.1371 / journal.pbio.2003995 29145518 pbio.2003995 PMC5690419 COVID-19科学更新 疾病控制和预防中心 2022-07-11 https://www.cdc.gov/library/covid19/scienceupdates.html 世卫组织COVID-19研究数据库:用户指南和信息 世界卫生组织 2021-10-14 https://www.who.int/publications/m/item/quick-search-guide-who-covid-19-database 疾病预防控制中心2019冠状病毒病公共卫生科学议程 疾病控制和预防中心 2022-07-12 https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-agenda-covid19.html 卫生公平:促进公平获得卫生服务 疾病控制和预防中心 2022-07-12 https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/index.html Altmetric做什么? Altmetric 2021-10-19 https://www.altmetric.com Anazco D Nicolalde B 埃斯皮诺萨 卡马乔 J Mushtaq Gimenez J 特朗红葡萄酒 E 2019冠状病毒病大流行期间发布的预印本的出版率和引用数:好、坏和丑 PeerJ 2021 9 e10927 10.7717 / peerj.10927 33717688 10927 PMC7936563 弗雷泽 尼古拉斯 利亚姆 戴伊 Gautam 波尔卡 杰西卡·K Palfy 伴侣 Nanni 费德里科• 科茨 乔纳森亚历克西斯 预印本在COVID-19研究传播中的演变作用及其对科学传播格局的影响 公共科学图书馆杂志 2021 04 19 4 e3000959 10.1371 / journal.pbio.3000959 33798194 pbiology - d - 20 - 02995 PMC8046348
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